More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1273 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  100 
 
 
380 aa  777    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  100 
 
 
380 aa  777    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  47.66 
 
 
383 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.44 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  44.95 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  43.72 
 
 
381 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.05 
 
 
382 aa  319  6e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  43.95 
 
 
380 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  44.79 
 
 
398 aa  316  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  43.27 
 
 
389 aa  315  8e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  43.34 
 
 
384 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  43.19 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  43.75 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  41.99 
 
 
392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  44.13 
 
 
407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  43.08 
 
 
391 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  43.92 
 
 
396 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.1 
 
 
400 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  44.33 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  42.2 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  42.93 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.5 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.37 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.22 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  42.05 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  43.08 
 
 
392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  43.19 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  45.45 
 
 
392 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.24 
 
 
396 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  42.46 
 
 
395 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  42.93 
 
 
389 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
391 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  42.86 
 
 
393 aa  301  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  44.39 
 
 
393 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  44.06 
 
 
382 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  43.72 
 
 
384 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  41.42 
 
 
387 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  43.24 
 
 
387 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  42.41 
 
 
404 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  44.06 
 
 
394 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  45.67 
 
 
401 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  44.09 
 
 
380 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  42.89 
 
 
380 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  41.84 
 
 
398 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  41.84 
 
 
398 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  44.24 
 
 
400 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.26 
 
 
414 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.72 
 
 
398 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  42.82 
 
 
404 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  43.16 
 
 
380 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.48 
 
 
382 aa  293  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  43.34 
 
 
404 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  43.16 
 
 
380 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.63 
 
 
394 aa  292  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  42.45 
 
 
400 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  41.25 
 
 
389 aa  292  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  42.48 
 
 
393 aa  292  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  40.66 
 
 
409 aa  292  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  43.16 
 
 
380 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.42 
 
 
398 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.26 
 
 
398 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  40.63 
 
 
399 aa  291  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  42.45 
 
 
386 aa  290  3e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  42.89 
 
 
380 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  43.57 
 
 
402 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  42.74 
 
 
390 aa  290  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  42.89 
 
 
380 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  42.89 
 
 
380 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  42.89 
 
 
380 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
401 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  42.89 
 
 
380 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  42.89 
 
 
380 aa  290  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.62 
 
 
401 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  42.89 
 
 
380 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  41.51 
 
 
386 aa  289  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  40.42 
 
 
388 aa  288  8e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  43.34 
 
 
404 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  42.63 
 
 
382 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  42.82 
 
 
404 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  41.73 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  41.05 
 
 
380 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.88 
 
 
394 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  42.3 
 
 
404 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  41.47 
 
 
407 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  41.47 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  42.04 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  41.41 
 
 
391 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>