More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06825 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  53.44 
 
 		 640 aa  668    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  54.7 
 
 		 635 aa  667    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  50.08 
 
 		 636 aa  645    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  51.17 
 
 		 642 aa  642    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  52.97 
 
 		 645 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  53.65 
 
 		 640 aa  706    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  68.53 
 
 		 654 aa  924    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 		 638 aa  674    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  67.86 
 
 		 651 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  53.29 
 
 		 643 aa  660    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  53.07 
 
 		 642 aa  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  54.06 
 
 		 640 aa  671    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  53.05 
 
 		 644 aa  639    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  53.41 
 
 		 648 aa  675    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  51.59 
 
 		 650 aa  644    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  53.25 
 
 		 642 aa  653    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  50 
 
 		 675 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  54.39 
 
 		 640 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 		 640 aa  670    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 		 640 aa  671    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  50.39 
 
 		 642 aa  638    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 		 640 aa  671    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  51.33 
 
 		 633 aa  640    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 		 640 aa  671    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  54.06 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 		 660 aa  636    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  49.18 
 
 		 714 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  62.84 
 
 		 666 aa  831    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  55.14 
 
 		 633 aa  694    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  54.39 
 
 		 640 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  66.15 
 
 		 659 aa  896    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  65.95 
 
 		 651 aa  905    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  52.41 
 
 		 661 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  51.95 
 
 		 648 aa  653    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  59.13 
 
 		 644 aa  754    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  50.38 
 
 		 655 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  58.93 
 
 		 637 aa  751    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  50.77 
 
 		 655 aa  645    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  52.46 
 
 		 637 aa  668    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  56.92 
 
 		 644 aa  753    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  55.09 
 
 		 640 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 		 640 aa  671    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  53.25 
 
 		 645 aa  675    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  51.33 
 
 		 642 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  49.15 
 
 		 655 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  52.31 
 
 		 642 aa  674    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  53.75 
 
 		 640 aa  670    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  52.4 
 
 		 634 aa  667    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  53.12 
 
 		 636 aa  677    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  59.09 
 
 		 644 aa  773    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 		 675 aa  660    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  60.4 
 
 		 649 aa  802    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 		 685 aa  647    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  56.65 
 
 		 632 aa  704    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  52.93 
 
 		 654 aa  667    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 		 640 aa  671    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  52.92 
 
 		 627 aa  639    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  50.15 
 
 		 675 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  52.46 
 
 		 644 aa  685    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  54.42 
 
 		 636 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  65.38 
 
 		 652 aa  904    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.39 
 
 		 638 aa  669    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.55 
 
 		 638 aa  669    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.77 
 
 		 636 aa  655    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  48.93 
 
 		 655 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  54.33 
 
 		 638 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  54.32 
 
 		 640 aa  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  80 
 
 		 646 aa  1087    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.11 
 
 		 633 aa  690    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  50.15 
 
 		 675 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  56.49 
 
 		 633 aa  685    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  53.8 
 
 		 651 aa  672    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  54.7 
 
 		 640 aa  701    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  77.23 
 
 		 658 aa  1045    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  53.28 
 
 		 640 aa  663    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  58.85 
 
 		 643 aa  766    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  53.67 
 
 		 644 aa  674    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 		 642 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  52.53 
 
 		 650 aa  641    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  49.56 
 
 		 665 aa  662    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 		 628 aa  689    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 		 634 aa  647    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  50.46 
 
 		 658 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  55.69 
 
 		 635 aa  658    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  54.87 
 
 		 650 aa  718    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  52.63 
 
 		 649 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  58.54 
 
 		 643 aa  759    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.46 
 
 		 636 aa  652    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  50.15 
 
 		 675 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  49.7 
 
 		 675 aa  638    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  57.54 
 
 		 649 aa  754    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  51 
 
 		 648 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  53.99 
 
 		 637 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  70.66 
 
 		 652 aa  937    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.33 
 
 		 647 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  49.24 
 
 		 655 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  49.77 
 
 		 655 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  49.92 
 
 		 655 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  51.52 
 
 		 651 aa  640    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  54.74 
 
 		 641 aa  692    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>