More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02045 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 370 aa  741    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  52.84 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  54.79 
 
 		 295 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  55.75 
 
 		 293 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  56.45 
 
 		 307 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  49.32 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  51.57 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  51.39 
 
 		 297 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  44.64 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  55.07 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  39.83 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  47.12 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  50.34 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  36.48 
 
 		 415 aa  235  9e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  39.89 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  36.24 
 
 		 466 aa  225  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  43.91 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  36.19 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  38.95 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  39.55 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  35.64 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  37.72 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  32.84 
 
 		 409 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  31.58 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  34.68 
 
 		 288 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  32.74 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  35.02 
 
 		 288 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  35.02 
 
 		 288 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.75 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  37.79 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.81 
 
 		 289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  34.27 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.33 
 
 		 279 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  32.52 
 
 		 292 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  34.62 
 
 		 290 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.35 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.96 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.96 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  35.52 
 
 		 293 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.52 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34 
 
 		 280 aa  133  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  30.12 
 
 		 447 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.42 
 
 		 276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  29.81 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 277 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  31.14 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.2 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.2 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.2 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  29.62 
 
 		 286 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  31.42 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  29.45 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  26.54 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  33.81 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  32.96 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  26.67 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  34.44 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3067  ABC-3 protein  28.84 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0608457  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.15 
 
 		 287 aa  126  8.000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  32.83 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  31.76 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  31.76 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  33.45 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.29 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.33 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  27.95 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  28.47 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  29.59 
 
 		 286 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  28.47 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  30.71 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.99 
 
 		 285 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  28.47 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  28.47 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  30.66 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  31.51 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  32.84 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  32.48 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  27.97 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  36.02 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  27.21 
 
 		 285 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>