More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0552 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  94.27 
 
 
506 aa  921  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  100 
 
 
506 aa  990  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  43.36 
 
 
480 aa  407  1e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56631e-10 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  41.34 
 
 
495 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  40.79 
 
 
494 aa  343  4e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  37.88 
 
 
508 aa  314  3e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  36.78 
 
 
499 aa  311  3e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  35.4 
 
 
467 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  35.4 
 
 
467 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  37.76 
 
 
473 aa  296  4e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  34.66 
 
 
464 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  34.66 
 
 
464 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  33.96 
 
 
474 aa  276  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  33.12 
 
 
474 aa  274  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  33.12 
 
 
474 aa  273  4e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  36.4 
 
 
495 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  32.32 
 
 
466 aa  266  5e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 
469 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  33.33 
 
 
473 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  30.93 
 
 
470 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  30.93 
 
 
476 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  34.03 
 
 
490 aa  230  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  33.75 
 
 
473 aa  226  5e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  27.67 
 
 
503 aa  209  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  29.79 
 
 
472 aa  197  4e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  29.79 
 
 
472 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  27.95 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  27.95 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  27.95 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  27.95 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  27.95 
 
 
511 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  27.95 
 
 
511 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  27.95 
 
 
511 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  28.18 
 
 
511 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  27.95 
 
 
511 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  29.62 
 
 
473 aa  185  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  29.62 
 
 
473 aa  185  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  29.62 
 
 
473 aa  185  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  29.62 
 
 
473 aa  185  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  29.41 
 
 
473 aa  184  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  27.34 
 
 
511 aa  181  3e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  27.29 
 
 
475 aa  181  3e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  30.33 
 
 
720 aa  175  2e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  27.54 
 
 
475 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  26.18 
 
 
485 aa  167  3e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  25.94 
 
 
485 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  27.95 
 
 
445 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  27.73 
 
 
445 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.3 
 
 
494 aa  128  2e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 
464 aa  115  2e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 
481 aa  113  8e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 
497 aa  111  4e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  23.54 
 
 
472 aa  104  4e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 
500 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  1.96904e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 
455 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 
500 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  24.1 
 
 
495 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  24.1 
 
 
495 aa  90.5  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  26.83 
 
 
465 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  24.43 
 
 
489 aa  87  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  3.67074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.17 
 
 
489 aa  85.1  2e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1995  amino acid transporter  25.36 
 
 
507 aa  77.8  4e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0293042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 
504 aa  71.6  3e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 
504 aa  71.6  3e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 
504 aa  71.6  3e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  25.66 
 
 
451 aa  71.2  4e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.13 
 
 
451 aa  69.7  1e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0828  amino acid transporter  22.27 
 
 
502 aa  67.8  5e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000137053  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  24.6 
 
 
446 aa  66.6  1e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  23.72 
 
 
502 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 
503 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0542  gamma-aminobutyrate permease or related permease  23.71 
 
 
463 aa  64.3  4e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000937541  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1382  amino acid permease-associated region  21.49 
 
 
501 aa  64.7  4e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.320464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  21.75 
 
 
540 aa  63.9  7e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 
513 aa  63.9  7e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  23.29 
 
 
497 aa  63.2  1e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 
467 aa  62.8  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  23.14 
 
 
467 aa  61.2  4e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002656  putative oxidoreductase  21.15 
 
 
477 aa  61.2  4e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 
503 aa  60.8  5e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  23.47 
 
 
452 aa  60.5  7e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 
468 aa  60.5  7e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  23.53 
 
 
444 aa  60.1  9e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  23.38 
 
 
445 aa  60.1  9e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  23.53 
 
 
444 aa  60.1  9e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  23.38 
 
 
445 aa  60.1  1e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  23.31 
 
 
445 aa  59.7  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  23.38 
 
 
445 aa  60.1  1e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  23.38 
 
 
445 aa  60.1  1e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1217  amino acid permease family protein  21.36 
 
 
540 aa  59.7  1e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0249423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  23.31 
 
 
445 aa  59.7  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  23.38 
 
 
445 aa  60.1  1e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  23.53 
 
 
444 aa  59.7  1e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  23.31 
 
 
445 aa  59.7  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  23.38 
 
 
445 aa  60.1  1e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  23.38 
 
 
445 aa  60.1  1e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  23.38 
 
 
445 aa  60.1  1e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  23.31 
 
 
445 aa  59.7  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 
445 aa  60.1  1e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  22.8 
 
 
528 aa  60.1  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>