281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1116 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  70.44 
 
 		 474 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  995    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  85.8 
 
 		 503 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  33.69 
 
 		 469 aa  90.1  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  32.47 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  33 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  21.49 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  24.78 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  21.29 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  22.13 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  28.79 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  24.5 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  21.08 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  21.08 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  21.08 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  20.68 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  26.39 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  26.91 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  26.71 
 
 		 420 aa  60.1  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  57.41 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  26.86 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  21.7 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  25.74 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  41.03 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.37 
 
 		 445 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  45.07 
 
 		 644 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  30.6 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  36.05 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  36.05 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  41.84 
 
 		 505 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  23.82 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  20.71 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  41.84 
 
 		 505 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  20.12 
 
 		 466 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  26.98 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  20.71 
 
 		 463 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2909  hypothetical protein  24.67 
 
 		 485 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  27.87 
 
 		 531 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  28.72 
 
 		 502 aa  53.5  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  24.39 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  25.74 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.29 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  25.74 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  25.11 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.98 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  24.47 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.23 
 
 		 625 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  38.55 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  26.41 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  50 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  26.05 
 
 		 463 aa  52.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  26.15 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  25.13 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  20.41 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.77 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  26.81 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.32 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  24.17 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  52.08 
 
 		 624 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 361 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 530 aa  51.2  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 		 570 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  24.17 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  26.32 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  59.52 
 
 		 496 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0152  amine oxidase  43.55 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  59.52 
 
 		 496 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  26.09 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  27.08 
 
 		 667 aa  50.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  53.57 
 
 		 519 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  21.16 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  27.96 
 
 		 488 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  34.38 
 
 		 495 aa  50.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  48.21 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  35.16 
 
 		 516 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  41.67 
 
 		 532 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  25.1 
 
 		 446 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  24.46 
 
 		 425 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  23.24 
 
 		 525 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 		 476 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  25.21 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  25 
 
 		 421 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 346 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  59.52 
 
 		 565 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.24 
 
 		 511 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  24.08 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  22.26 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  61.54 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  39.42 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.89 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  36.05 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  42.86 
 
 		 451 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  52.38 
 
 		 592 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  25.61 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  57.14 
 
 		 616 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  61.54 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  26.52 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.43 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>