More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3997 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  95.7 
 
 		 186 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  79.43 
 
 		 186 aa  285  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  78.16 
 
 		 186 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  74.73 
 
 		 186 aa  284  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  74.19 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  74.19 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  78.16 
 
 		 186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  78.16 
 
 		 186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  83.91 
 
 		 206 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  71.27 
 
 		 189 aa  273  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  70.11 
 
 		 184 aa  267  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  69.32 
 
 		 184 aa  257  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  79.31 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  79.31 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  79.31 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  79.31 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  79.31 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  79.31 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  79.31 
 
 		 187 aa  251  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  79.19 
 
 		 187 aa  249  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  61.33 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  54.49 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  56 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  52.15 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  56.65 
 
 		 197 aa  184  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  52.43 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  50.29 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  52.63 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  59.22 
 
 		 188 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  51.43 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  52.57 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  48 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  47.98 
 
 		 182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  49.42 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  50.87 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  46.15 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  46.15 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  47.37 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  51.48 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  43.96 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.54 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  38.12 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  42.61 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  37.43 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  38.79 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  39.88 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  34.46 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  41.18 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  38.98 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  39.25 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  41.18 
 
 		 441 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  38.86 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  35.14 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  40.12 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  43.72 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  37.71 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  42.42 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  38.1 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  40.35 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  37.14 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  37.5 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  35.64 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  39.23 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  38.6 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  40.22 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  35.75 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  38.69 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.21 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.63 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  40.57 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  36 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  35.75 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  34.88 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  35.63 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  38.37 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  38.29 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  37.71 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  37.79 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  36.21 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  37.79 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  40.7 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  36.21 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  31.64 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  34.12 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  37.84 
 
 		 416 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.2 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  31.64 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  37.43 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  31.07 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  31.07 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.2 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3332  cytochrome B561  38.01 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  34.08 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  30.51 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.42 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  33.91 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  40.57 
 
 		 179 aa  97.4  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  35.84 
 
 		 175 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  29.94 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>