167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3600 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  289  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  55 
 
 
141 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  39.29 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  37.04 
 
 
133 aa  81.3  4e-15  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  36.04 
 
 
144 aa  77.8  4e-14  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  33.05 
 
 
132 aa  77.4  6e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  35.34 
 
 
143 aa  75.1  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  37.63 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  27.03 
 
 
143 aa  72  3e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  69.7  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  69.3  2e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  31.4 
 
 
136 aa  68.2  3e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.56 
 
 
189 aa  67.8  5e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  31.96 
 
 
182 aa  67.4  5e-11  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  30 
 
 
311 aa  67  7e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  30.39 
 
 
576 aa  67  8e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  27.12 
 
 
130 aa  67  8e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  31.53 
 
 
127 aa  65.9  2e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  34.15 
 
 
145 aa  65.9  2e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  31.53 
 
 
127 aa  65.9  2e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  35.34 
 
 
143 aa  65.9  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  30.63 
 
 
139 aa  65.5  2e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  32.43 
 
 
134 aa  65.5  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 
130 aa  64.3  5e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.32 
 
 
131 aa  63.9  7e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  30.84 
 
 
146 aa  63.5  8e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.15 
 
 
140 aa  63.5  8e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  32 
 
 
136 aa  63.2  1e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.98 
 
 
148 aa  61.6  3e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  60.1  9e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  26.85 
 
 
133 aa  60.1  1e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  28.09 
 
 
129 aa  59.7  1e-08  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  29.91 
 
 
135 aa  60.1  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  25.24 
 
 
129 aa  59.3  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  28.7 
 
 
121 aa  58.9  2e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  59.3  2e-08  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  29 
 
 
130 aa  58.9  2e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  32.71 
 
 
157 aa  58.5  3e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  34.95 
 
 
142 aa  58.5  3e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  29.13 
 
 
130 aa  58.2  4e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  32.32 
 
 
120 aa  57.8  5e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  29.09 
 
 
138 aa  57  7e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  28.89 
 
 
139 aa  57.4  7e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  57  9e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  32.52 
 
 
413 aa  56.6  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  29.41 
 
 
321 aa  56.2  1e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  29.09 
 
 
138 aa  56.2  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  31.37 
 
 
143 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  29.09 
 
 
138 aa  56.2  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  26.36 
 
 
135 aa  56.6  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  29.66 
 
 
129 aa  55.8  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  28.7 
 
 
156 aa  55.5  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  27.52 
 
 
132 aa  55.1  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  33.33 
 
 
150 aa  55.1  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.64 
 
 
319 aa  55.1  3e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  29.03 
 
 
132 aa  54.7  4e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.23569e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.34 
 
 
137 aa  54.7  4e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  25 
 
 
146 aa  54.7  4e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  22.95 
 
 
124 aa  54.7  4e-07  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  23.73 
 
 
130 aa  54.7  4e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  34.52 
 
 
417 aa  54.3  5e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  32.58 
 
 
137 aa  54.3  5e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  31.19 
 
 
145 aa  54.3  6e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  31.19 
 
 
145 aa  54.3  6e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  31.19 
 
 
145 aa  54.3  6e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  29.31 
 
 
132 aa  54.3  6e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  31.71 
 
 
125 aa  53.9  7e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  53.9  8e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  53.9  8e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  27.48 
 
 
132 aa  53.5  9e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  28.41 
 
 
144 aa  53.5  1e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  23.85 
 
 
138 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  23.08 
 
 
178 aa  53.5  1e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  35.58 
 
 
138 aa  53.1  1e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  52.4  2e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  31.71 
 
 
145 aa  52.4  2e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  22.22 
 
 
128 aa  52.4  2e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  26.47 
 
 
133 aa  52  2e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  27.48 
 
 
132 aa  52.4  2e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  30.09 
 
 
137 aa  52.4  2e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  28.12 
 
 
134 aa  52.8  2e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  28.28 
 
 
132 aa  51.6  4e-06  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 
418 aa  51.6  4e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  27.78 
 
 
319 aa  51.2  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  28.81 
 
 
119 aa  50.8  6e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  50.8  6e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  25.64 
 
 
116 aa  50.4  7e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.03 
 
 
137 aa  50.4  7e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  30 
 
 
136 aa  50.4  7e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  35.34 
 
 
176 aa  49.7  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  26.6 
 
 
152 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  26.6 
 
 
152 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  28.28 
 
 
135 aa  49.7  1e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  26.6 
 
 
152 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  49.7  1e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  26.6 
 
 
152 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  29.03 
 
 
137 aa  49.7  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  30.23 
 
 
152 aa  49.7  1e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  28.71 
 
 
130 aa  49.7  1e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  26.6 
 
 
152 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>