More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5556 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  82.61 
 
 		 231 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  72.73 
 
 		 231 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  71.62 
 
 		 232 aa  317  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  67.43 
 
 		 230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0423  F0F1 ATP synthase subunit A  65.8 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0151  F0F1 ATP synthase subunit A  66.23 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0127  F0F1 ATP synthase subunit A  66.23 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1294  F0F1 ATP synthase subunit A  66.23 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.322594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2790  F0F1 ATP synthase subunit A  66.23 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1052  F0F1 ATP synthase subunit A  66.23 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2648  F0F1 ATP synthase subunit A  66.23 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  64.6 
 
 		 228 aa  271  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  62.04 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  63.93 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  63.47 
 
 		 227 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  50.5 
 
 		 194 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  43.63 
 
 		 231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  42.31 
 
 		 236 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  42.23 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  38.64 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  41.63 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  40.57 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  41.35 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  39.44 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  40.87 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  37.1 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  40.93 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3102  F0F1 ATP synthase subunit A  39.42 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00224256  normal  0.218622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  39.91 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  33.83 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  35.68 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  40.11 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  36.95 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  38.07 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  33.65 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  32.73 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  37 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.4 
 
 		 284 aa  121  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  35.05 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  35.51 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 		 241 aa  118  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  33.82 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.27 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  39.35 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  32.84 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.58 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  30 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  35.75 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  33.64 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  33.18 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  32.23 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  32.88 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  34.6 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  32.71 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  30.69 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  35.21 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  33.02 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0858  F0F1 ATP synthase subunit A  33.16 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  33.95 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  32.84 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  34.74 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  34.74 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  29.65 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  28.06 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  35.37 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  33.82 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  28.57 
 
 		 301 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  38.71 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  30.05 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2168  F0F1 ATP synthase subunit A  32.21 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.41 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2458  F0F1 ATP synthase subunit A  30.52 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  34.84 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  35.27 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  35.5 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  27.51 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  28.86 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  30 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  32.32 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  32.67 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  32.67 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  34.27 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  29.27 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  30.32 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  29.32 
 
 		 271 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  26.91 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  29.52 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  31.09 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  30.2 
 
 		 314 aa  92  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3742  ATP synthase F0, A subunit  34.46 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0532  ATP synthase F0, A subunit  30.59 
 
 		 314 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  29.11 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  29.8 
 
 		 314 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  28.14 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>