103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0059 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0059  Urease accessory protein UreD  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  30.32 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  30.29 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  32.95 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  29.96 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1362  urease accessory protein UreD  28.68 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2455  urease accessory protein UreD  28.03 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1318  urease accessory protein UreD  27.94 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4212  urease accessory protein UreD  33.85 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  29.82 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  30.6 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3658  urease accessory protein UreD  21.21 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  27.73 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2195  urease accessory protein UreD  25.09 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00406195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  29.2 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  30.41 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  36.84 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  28.21 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0749  urease accessory protein UreD  21.88 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  26.95 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0683  urease accessory protein UreD  20.18 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0473  urease accessory protein UreD  23.7 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.744472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  31.93 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  28.36 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0977  Urease accessory protein UreD  27.93 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.822448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  29.88 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  25.63 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  28.97 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1964  putative urease accessory protein ureD  30.13 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1875  urease accessory protein UreD  19.55 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.37143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  24.19 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0310  urease accessory protein UreD  32.77 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  27.44 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3207  Urease accessory protein UreD  33.48 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681143  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1955  urease accessory protein UreD  32.77 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  34.15 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4414  Urease accessory protein UreD  21.4 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0247  urease accessory protein UreD  27.98 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  28.19 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2370  urease accessory protein  31.37 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.512779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  27.49 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2408  urease accessory protein UreD  25.59 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.815614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  27.99 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  27.99 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  27.99 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  27.99 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  27.99 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  27.99 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  27.99 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1138  Urease accessory protein UreD  35.71 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1083  urease accessory protein UreD  24.18 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1137  urease accessory protein UreD  24.18 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5120  Urease accessory protein UreD  23.14 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1812  urease accessory protein UreD  22.95 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  23.74 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  26.84 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  25.33 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  27.11 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  30.59 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  27.23 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0984  urease accessory protein UreD  30.25 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2767  Urease accessory protein UreD  24.75 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  27.37 
 
 		 321 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  33.33 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1199  urease accessory protein UreD  36.73 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1359  Urease accessory protein UreD  36.73 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  26.46 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1744  urease accessory protein UreD  26.22 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.407934  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4440  putative urease accessory protein ureD  28.29 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  26.46 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  28.04 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  26.69 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  29.05 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  27.71 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2318  urease accessory protein UreD  20.67 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00527457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2361  urease accessory protein UreD  20.67 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.361313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  27.38 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  27.38 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  28.88 
 
 		 305 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  27.86 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  27.88 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  25.28 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  28.63 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  22.76 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  26.79 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0388  urease accessory protein UreD  27.7 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0724  Urease accessory protein UreD  21.89 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  20.77 
 
 		 307 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  26.72 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  29.14 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  24.71 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  26.22 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  28.42 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2680  urease accessory protein UreD  27.24 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  23.39 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  26.7 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  30.28 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  28.12 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  27.27 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>