More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2865 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
171 aa  348  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  85.96 
 
 
165 aa  297  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  85.96 
 
 
171 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  84.8 
 
 
218 aa  295  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  85.96 
 
 
174 aa  295  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  85.38 
 
 
174 aa  294  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  84.21 
 
 
174 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  84.21 
 
 
174 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  84.21 
 
 
174 aa  291  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  82.46 
 
 
171 aa  290  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  82.46 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  82.46 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  82.46 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  82.46 
 
 
171 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  82.46 
 
 
222 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  84.21 
 
 
165 aa  288  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  82.46 
 
 
222 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  82.74 
 
 
168 aa  284  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  82.74 
 
 
168 aa  284  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  63.74 
 
 
162 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  64.33 
 
 
164 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  63.74 
 
 
162 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  63.74 
 
 
162 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  62.57 
 
 
163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  53.61 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  52.94 
 
 
157 aa  170  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  53.01 
 
 
188 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  53.61 
 
 
161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  53.61 
 
 
161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  48.85 
 
 
160 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  50.59 
 
 
160 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  48.82 
 
 
161 aa  147  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.69 
 
 
181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.58 
 
 
154 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  48.15 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  51.19 
 
 
189 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  44.77 
 
 
162 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.64 
 
 
153 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
159 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 
162 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  46.3 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  46.3 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  43.6 
 
 
159 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  46.91 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.78 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  43.27 
 
 
156 aa  137  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
153 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 
155 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.86 
 
 
166 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
167 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
167 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
167 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.71 
 
 
155 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  43.86 
 
 
167 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
167 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
167 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
167 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  46.43 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  46.43 
 
 
161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  42.69 
 
 
171 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  42.69 
 
 
171 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  43.27 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.6 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  42.26 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  41.57 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  41.92 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.52 
 
 
155 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  43.37 
 
 
175 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  42.51 
 
 
156 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  43.37 
 
 
175 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.52 
 
 
155 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
154 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
152 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  41.86 
 
 
161 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  43.37 
 
 
175 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
156 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  43.37 
 
 
175 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
152 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.52 
 
 
155 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
152 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  43.11 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  42.51 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  39.18 
 
 
157 aa  131  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
157 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
157 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  43.37 
 
 
202 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42.26 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.86 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  43.37 
 
 
229 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42.77 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.11 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>