More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6177 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6177  porin  100 
 
 
386 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  95.08 
 
 
386 aa  708    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  91.71 
 
 
386 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  94.82 
 
 
386 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  94.82 
 
 
386 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  71.58 
 
 
386 aa  544  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  64.85 
 
 
386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  62.08 
 
 
386 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  62.08 
 
 
386 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  61.3 
 
 
386 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  61.56 
 
 
386 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  61.3 
 
 
386 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  60.94 
 
 
430 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  60.94 
 
 
430 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  60.5 
 
 
386 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  60.94 
 
 
384 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  60.94 
 
 
384 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  61.04 
 
 
386 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  62.09 
 
 
385 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  60.94 
 
 
411 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  60.94 
 
 
384 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  60.94 
 
 
384 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  59.29 
 
 
523 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  61.81 
 
 
385 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  61.54 
 
 
385 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  60.53 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  61.81 
 
 
385 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  57.03 
 
 
394 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  60.27 
 
 
393 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  59.89 
 
 
385 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  60.16 
 
 
385 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  59.18 
 
 
388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  55.41 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  56.43 
 
 
404 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  55.96 
 
 
387 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  52.15 
 
 
390 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  52.17 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  51.31 
 
 
390 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  52.17 
 
 
390 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  51.05 
 
 
390 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  51.9 
 
 
390 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  51.9 
 
 
390 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  50.26 
 
 
430 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  50 
 
 
430 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  50 
 
 
430 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  49.61 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  49.61 
 
 
430 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  49.61 
 
 
430 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  49.61 
 
 
430 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  46.42 
 
 
389 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  48.38 
 
 
376 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  46.63 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  46.63 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  46.37 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.04 
 
 
389 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.09 
 
 
385 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.83 
 
 
385 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.09 
 
 
436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.09 
 
 
436 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.09 
 
 
386 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.09 
 
 
386 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  40.7 
 
 
397 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.09 
 
 
386 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  40.95 
 
 
421 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.09 
 
 
386 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  40.95 
 
 
421 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.09 
 
 
386 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  40.95 
 
 
397 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.31 
 
 
383 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40.95 
 
 
397 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  43.83 
 
 
386 aa  255  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.49 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.49 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.49 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  41.95 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.49 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  41.78 
 
 
397 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  42.78 
 
 
383 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  42.78 
 
 
383 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  41.06 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  41.06 
 
 
391 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  42.13 
 
 
389 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.26 
 
 
383 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  40.4 
 
 
389 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  38.42 
 
 
397 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  41.76 
 
 
389 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  40.86 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  41.78 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  41.14 
 
 
381 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  40.3 
 
 
393 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  41.52 
 
 
395 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  40.92 
 
 
402 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  41.99 
 
 
394 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  40.9 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  40.9 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  38.4 
 
 
393 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6447  porin  39.53 
 
 
366 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  39.78 
 
 
395 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5582  porin  39.69 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  38.73 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>