51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17160 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 196 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  39.62 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  41.1 
 
 		 222 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  34.55 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  35.51 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  35.9 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  35.82 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  36.07 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  39.04 
 
 		 184 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  37.07 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  38.36 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  36.51 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  34.3 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  42.99 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  33.84 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  34.72 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  31.54 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  26.24 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  35.92 
 
 		 180 aa  51.2  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  33.09 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  31.4 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  32.57 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  32.57 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.07 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  21.63 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  24.27 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  35.1 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  31.75 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  24.06 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  30.66 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  40 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  29.9 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  36.45 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  24.06 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  35.78 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  33.71 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  28.47 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  37.23 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  33.17 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  32.6 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  25.93 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  32.06 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  29.55 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  34.55 
 
 		 189 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  30.33 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  21.95 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>