88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1039    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  47.86 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  47.74 
 
 		 521 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  42.5 
 
 		 561 aa  316  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  40.68 
 
 		 577 aa  310  5e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  48.05 
 
 		 360 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  32.18 
 
 		 556 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  39.74 
 
 		 714 aa  95.9  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  40.37 
 
 		 637 aa  91.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  40 
 
 		 566 aa  90.9  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 585 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  39.26 
 
 		 568 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  38.26 
 
 		 748 aa  87.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  40.94 
 
 		 602 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  38.04 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.73 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  37.32 
 
 		 603 aa  80.9  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  39.23 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 605 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.98 
 
 		 580 aa  77.8  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 584 aa  77.8  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.68 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  33.99 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  34.93 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  34 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  25.56 
 
 		 567 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  30.67 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  31.49 
 
 		 519 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  37.01 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  37.19 
 
 		 566 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  30 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  37.98 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.98 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  36.13 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  25.55 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  35 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 743 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 443 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  32.81 
 
 		 550 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  40.3 
 
 		 579 aa  53.5  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  30.61 
 
 		 567 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  33.07 
 
 		 169 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  30.61 
 
 		 484 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  38.27 
 
 		 618 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  28.39 
 
 		 475 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.89 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  29.49 
 
 		 424 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  24.24 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 198 aa  50.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  25.6 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  36.96 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  36.47 
 
 		 519 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  32.9 
 
 		 582 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 516 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  36.9 
 
 		 709 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  32.33 
 
 		 480 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  32.33 
 
 		 480 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  30.77 
 
 		 377 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  26.71 
 
 		 423 aa  47.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  27.7 
 
 		 434 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  30.77 
 
 		 377 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  27.7 
 
 		 434 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  27.7 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  30.82 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  28.1 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  27.85 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  30.07 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  30.56 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  30.07 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  27.22 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  27.22 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  32.95 
 
 		 601 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  32.94 
 
 		 512 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  32.64 
 
 		 268 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  32.71 
 
 		 620 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  32.95 
 
 		 539 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  27.85 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  32.52 
 
 		 506 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  23.33 
 
 		 403 aa  44.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  28.93 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  27.22 
 
 		 433 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  23.66 
 
 		 511 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  33.68 
 
 		 441 aa  43.5  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  32.89 
 
 		 571 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>