More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01160 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  44.25 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  42.33 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  43.56 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 203 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  38 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 443 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  30.96 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 421 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  34.67 
 
 		 584 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 374 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.49 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.51 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.56 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.62 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.48 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.48 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.48 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.89 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.06 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  27.65 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  27.65 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.65 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  27.65 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  27.65 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27.06 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  29.1 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 405 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.65 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  27.65 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  37.59 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  27.65 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  27.65 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  31.03 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>