More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2363 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
459 aa  947    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  49.46 
 
 
463 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  41.81 
 
 
466 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  40.76 
 
 
466 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  41.15 
 
 
466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  40.88 
 
 
466 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
473 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  40.98 
 
 
466 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.97 
 
 
465 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
473 aa  322  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  39.61 
 
 
471 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
466 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.36 
 
 
464 aa  312  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
466 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 
471 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  39.27 
 
 
466 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  37.47 
 
 
479 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 
466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
466 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.38 
 
 
486 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 
463 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 
464 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.15 
 
 
474 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  38 
 
 
463 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
484 aa  289  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  35.11 
 
 
473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.33 
 
 
488 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 
470 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.26 
 
 
491 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
490 aa  256  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.9 
 
 
472 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.13 
 
 
471 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
509 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
480 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
495 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.87 
 
 
472 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
477 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  30.86 
 
 
509 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  31.07 
 
 
510 aa  236  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  31.65 
 
 
501 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
501 aa  233  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  31.13 
 
 
490 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  30.6 
 
 
508 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
509 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
501 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  32.27 
 
 
508 aa  231  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
496 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
515 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
493 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
507 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  29.51 
 
 
509 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.34 
 
 
503 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.44 
 
 
491 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.65 
 
 
481 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  28.69 
 
 
507 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  29.78 
 
 
487 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.22 
 
 
472 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  28.48 
 
 
507 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  30.84 
 
 
515 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
507 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
507 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
507 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
485 aa  226  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.26 
 
 
495 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
490 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.76 
 
 
500 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0554  regulatory protein GntR HTH  32.06 
 
 
460 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
470 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0540  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
460 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
492 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
504 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
506 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
506 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
517 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  28.29 
 
 
477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  28.57 
 
 
511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 
503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.02 
 
 
514 aa  223  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.26 
 
 
497 aa  223  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
506 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  29.58 
 
 
520 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
506 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.95 
 
 
504 aa  222  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.94 
 
 
501 aa  222  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.55 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 
444 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>