75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6790 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  71.92 
 
 
292 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  71.92 
 
 
292 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  60.42 
 
 
295 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.06 
 
 
302 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.95 
 
 
287 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.33 
 
 
315 aa  128  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.52 
 
 
298 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 
320 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.65 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.67 
 
 
291 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  40.82 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.96 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  31.6 
 
 
289 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.1 
 
 
291 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.88 
 
 
282 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386049 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  28.03 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  24.18 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  24.73 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  30.7 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  32.35 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.48 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.69 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  27.74 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.96448 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  25.86 
 
 
271 aa  55.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.434401 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05023  hypothetical protein  34.91 
 
 
160 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.372141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.17 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.87 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  31.45 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2171  Phytanoyl-CoA dioxygenase  40.54 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04607  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 
146 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0380015  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2233  Phytanoyl-CoA dioxygenase  40.54 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.15 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.88 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.63 
 
 
306 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  30.63 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  23.08 
 
 
256 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.28 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.63 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  30.28 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  30.28 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.18 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  30.28 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  30.28 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  30.28 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  32.11 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.31 
 
 
230 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.46 
 
 
285 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.19 
 
 
253 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.22 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.7 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.08 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.4 
 
 
396 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 
273 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  25.69 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.7 
 
 
257 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  21.76 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.4 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.7 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.4 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.36 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.06 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  25.96 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.04 
 
 
239 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
281 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1239  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.05 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.424145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>