83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3177 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 204 aa  403  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  61.58 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  53.11 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  48.22 
 
 		 222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  46.38 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  47.46 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 179 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  49.21 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  49.72 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  49.72 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  34.32 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 174 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  33.53 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.18 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  31.95 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  28.4 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  28.65 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  28.9 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  29.14 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  28.22 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  32.47 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  27.13 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  20.77 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  26.16 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  32.18 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  26.09 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  25.28 
 
 		 181 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  31.88 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  25.97 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  34.17 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  27.17 
 
 		 179 aa  48.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  26.63 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  33.94 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  35.87 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  38.27 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  28.37 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  19.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  22.99 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 277 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  29.84 
 
 		 178 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 175 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>