107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2566 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  49.17 
 
 
311 aa  228  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  44.37 
 
 
308 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  38.75 
 
 
302 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  43.84 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  39.86 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  41.55 
 
 
343 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  33.63 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  36.67 
 
 
294 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.41 
 
 
285 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  26.94 
 
 
288 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  37.63 
 
 
320 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  37.29 
 
 
320 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  32.42 
 
 
277 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  40.89 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  33.49 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  36.82 
 
 
285 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  27.12 
 
 
288 aa  92.4  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  33.64 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  34.77 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  35.78 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  22.57 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  36.73 
 
 
296 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  31.15 
 
 
333 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.19 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  32.84 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  30.19 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  32.08 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  32.34 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  31.13 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  24.91 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  31.13 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  26.79 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  25.98 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  37.5 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  27.12 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  28.92 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  29.39 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  25.98 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  23.13 
 
 
285 aa  55.8  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  34.04 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
347 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  37.19 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  27.71 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36 
 
 
374 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
303 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
360 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.87 
 
 
371 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
341 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4256  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.89 
 
 
370 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  30.13 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.44 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  22.12 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29 
 
 
453 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  22.22 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  34.74 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2822  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.463464  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
250 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  28.52 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  29.14 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1918  alpha/beta hydrolase  29.49 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  37.61 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.51 
 
 
380 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0849  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.14 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.14 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.14 
 
 
368 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.44 
 
 
293 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2672  hypothetical protein  23.21 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0230759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2624  alpha/beta hydrolase  23.21 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000020158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2865  hypothetical protein  23.21 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1643  hypothetical protein  25.89 
 
 
241 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.43 
 
 
368 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>