More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6653 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.3 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.87 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  41.18 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  41.7 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  35.16 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  36.94 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  31.62 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 220 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 217 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  29.55 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  29.55 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  30.28 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  31.19 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0319702  normal  0.0827208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  30.94 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  31.82 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  31.82 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  33.79 
 
 		 214 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  31.36 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  31.36 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  31.36 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  30 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  29.36 
 
 		 214 aa  98.6  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  30.91 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  31.53 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  29.07 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  29.86 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  31.84 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  31.53 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  29.86 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  29.68 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  29.41 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  29.86 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  30.94 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  29.86 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  30.94 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  31.44 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  33.03 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  31.22 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  31.08 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  31.08 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  30.59 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 217 aa  95.1  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  29.86 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  29.86 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>