More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2701 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  99.51 
 
 		 204 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  95.59 
 
 		 204 aa  380  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  96.08 
 
 		 204 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  95.59 
 
 		 227 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  95.59 
 
 		 204 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  96.57 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  87.25 
 
 		 204 aa  358  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  85.78 
 
 		 204 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  85.29 
 
 		 204 aa  350  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  85.29 
 
 		 204 aa  350  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  85.29 
 
 		 204 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  85.29 
 
 		 204 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  82.35 
 
 		 194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  82.35 
 
 		 194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  82.35 
 
 		 194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  82.35 
 
 		 194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  82.84 
 
 		 204 aa  322  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  66.5 
 
 		 203 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  59.9 
 
 		 206 aa  224  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  60.19 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  59.13 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  52.45 
 
 		 211 aa  194  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  55.56 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  43.56 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.72 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.2 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  41.87 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.53 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  39.05 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  42.29 
 
 		 206 aa  141  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2171  amino acid transporter LysE  40.82 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  39.51 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3569  lysine exporter protein LysE/YggA  40.82 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.8 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.51 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.69 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.49 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  42 
 
 		 202 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.06 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  39.11 
 
 		 211 aa  134  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.17 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.58 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  42.23 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1609  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.64 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.2 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  35.24 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  38.19 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.7 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  37.13 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  37 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  37 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  37 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  37 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  37 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  37 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  39.17 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  39.13 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  37.88 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.06 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.81 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  36.63 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3539  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.439098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 210 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  37 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  38.46 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  34.16 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  38.31 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  39.44 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  32.2 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.81 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.23 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  37.31 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.15 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  31.9 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  35.15 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  36.15 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.85 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  33.95 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.18 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.82 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  36.19 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>