More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1912 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1912  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
215 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  93.02 
 
 
321 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  93.02 
 
 
321 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  93.02 
 
 
321 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  93.02 
 
 
321 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  93.02 
 
 
321 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  93.02 
 
 
321 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  65.57 
 
 
322 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  65.57 
 
 
322 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  65.71 
 
 
322 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  65.09 
 
 
324 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  64.62 
 
 
324 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  64.62 
 
 
324 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  60.85 
 
 
327 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  64.62 
 
 
334 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  62.26 
 
 
387 aa  271  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  62.38 
 
 
369 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  62.38 
 
 
369 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  62.38 
 
 
346 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  62.38 
 
 
346 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  62.38 
 
 
346 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  62.38 
 
 
343 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  61.9 
 
 
374 aa  264  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.85 
 
 
338 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  60.85 
 
 
338 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  59.72 
 
 
338 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  58.41 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  50.47 
 
 
320 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  50.47 
 
 
320 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  59.91 
 
 
327 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  61.84 
 
 
321 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  50.47 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  48.13 
 
 
332 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  50.89 
 
 
363 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  51.13 
 
 
437 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  51.17 
 
 
351 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  49.77 
 
 
338 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  50.23 
 
 
375 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  51 
 
 
324 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  48.76 
 
 
312 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  51.26 
 
 
310 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  49.07 
 
 
338 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  47.25 
 
 
334 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  49.25 
 
 
315 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  50.48 
 
 
317 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  48.36 
 
 
339 aa  194  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  49.29 
 
 
311 aa  194  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  49.29 
 
 
311 aa  194  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  46.48 
 
 
331 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  48.26 
 
 
312 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  46.01 
 
 
329 aa  193  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  49.06 
 
 
342 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 
322 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  46.5 
 
 
325 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  49.53 
 
 
357 aa  191  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 
344 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  47.42 
 
 
345 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 
344 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  50.7 
 
 
338 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 
344 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 
344 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
330 aa  191  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 
344 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 
344 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  48.61 
 
 
334 aa  191  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 
344 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  46.98 
 
 
319 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  49.76 
 
 
320 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  43.93 
 
 
329 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  48.83 
 
 
336 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  48.83 
 
 
336 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  48.83 
 
 
336 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  43.33 
 
 
334 aa  188  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  50.47 
 
 
323 aa  187  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  42.33 
 
 
372 aa  187  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  48.74 
 
 
331 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  49.52 
 
 
328 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 
341 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  47.26 
 
 
312 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
336 aa  184  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  44.91 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  48.47 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 
326 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  45.07 
 
 
336 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  43.66 
 
 
349 aa  182  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  45.58 
 
 
341 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  44.65 
 
 
327 aa  181  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  43.72 
 
 
331 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  47.26 
 
 
317 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  46.54 
 
 
330 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  45.77 
 
 
314 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 
354 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  44.6 
 
 
362 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 
358 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  46.77 
 
 
316 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  41.86 
 
 
341 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  46.77 
 
 
311 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  47.5 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 
345 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>