250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1063 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  99.22 
 
 
255 aa  517  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  88.04 
 
 
276 aa  504  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  61.19 
 
 
272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  59.7 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  57.41 
 
 
274 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  55.79 
 
 
241 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  40.8 
 
 
303 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  37.59 
 
 
311 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  41.96 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  35.23 
 
 
310 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  36.19 
 
 
338 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  35.77 
 
 
326 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  39.74 
 
 
312 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  38.4 
 
 
324 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  36.22 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  34.65 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.43 
 
 
577 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30.43 
 
 
577 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  35.66 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  35.04 
 
 
308 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  32.4 
 
 
447 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
311 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  30.47 
 
 
561 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.47 
 
 
561 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
315 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  33.2 
 
 
456 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  33.06 
 
 
331 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  34.63 
 
 
444 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  32.23 
 
 
331 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  33.18 
 
 
436 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  30.12 
 
 
456 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
439 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  29.81 
 
 
417 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  32.43 
 
 
436 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  29.67 
 
 
436 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
438 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
356 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  26.7 
 
 
358 aa  61.6  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  36.73 
 
 
354 aa  61.2  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.39 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  30.69 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  30.69 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  30.69 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  30.69 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  30.69 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  31.72 
 
 
267 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.36 
 
 
234 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  30.69 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.7 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.2 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  29.7 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  29.7 
 
 
269 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.73 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.68 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  28.66 
 
 
241 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28.08 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  35.06 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.72 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0908  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase /2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  25.56 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.91 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  28.66 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.34 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.34 
 
 
249 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.34 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.53 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
239 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
241 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  31.51 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  33.02 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.7 
 
 
241 aa  48.9  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05789  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06380)  30.25 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.761453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.08 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  27.98 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  30.34 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  28.76 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.25 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  27.67 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  31.45 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.68 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  28.03 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  22.38 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.62 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.67 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.17 
 
 
256 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>