More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0631 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03035  translation initiation factor IF-2  64.51 
 
 
890 aa  1093    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243864  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  64.51 
 
 
890 aa  1093    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  64.51 
 
 
890 aa  1093    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4712  translation initiation factor IF-2  61.05 
 
 
846 aa  772    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.333126  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
975 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2815  translation initiation factor IF-2  56.78 
 
 
883 aa  701    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3464  translation initiation factor IF-2  64.62 
 
 
890 aa  1095    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.345648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1315  translation initiation factor IF-2  61.02 
 
 
868 aa  743    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  56.72 
 
 
964 aa  735    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3730  translation initiation factor IF-2  65.18 
 
 
892 aa  1134    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  63.55 
 
 
889 aa  883    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2749  translation initiation factor IF-2  54.24 
 
 
990 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.867679  normal  0.130193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  64.42 
 
 
885 aa  912    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  64.4 
 
 
890 aa  1091    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  62.27 
 
 
885 aa  900    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4490  translation initiation factor IF-2  61.72 
 
 
841 aa  762    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0593821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  56.92 
 
 
953 aa  692    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4712  translation initiation factor IF-2  62.06 
 
 
842 aa  769    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.940521  normal  0.658182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0530  translation initiation factor IF-2  64.51 
 
 
890 aa  1093    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.84187  decreased coverage  0.0000498988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
975 aa  724    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  49.12 
 
 
868 aa  822    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  49.67 
 
 
868 aa  827    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  45.44 
 
 
908 aa  739    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  56.6 
 
 
943 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3608  translation initiation factor IF-2  59.69 
 
 
828 aa  780    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  56.66 
 
 
966 aa  708    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  51.64 
 
 
922 aa  748    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4577  translation initiation factor IF-2  61.05 
 
 
846 aa  772    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126639  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  58.29 
 
 
848 aa  746    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  57 
 
 
975 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  49.38 
 
 
845 aa  814    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0779  translation initiation factor IF-2  58.26 
 
 
837 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679376  normal  0.0113763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0563  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
816 aa  778    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.852622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01303  translation initiation factor IF-2  54.78 
 
 
904 aa  717    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  56.9 
 
 
972 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3476  translation initiation factor IF-2  65.18 
 
 
892 aa  1098    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  63.85 
 
 
898 aa  900    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1093  translation initiation factor IF-2  55.44 
 
 
917 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.56 
 
 
884 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0203  translation initiation factor IF-2  55.39 
 
 
892 aa  687    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.665385  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1123  translation initiation factor IF-2  59.8 
 
 
818 aa  732    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1600  translation initiation factor IF-2  49.89 
 
 
803 aa  777    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215539  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
975 aa  724    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  55.88 
 
 
948 aa  699    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  57 
 
 
975 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  56.49 
 
 
876 aa  727    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0179  translation initiation factor IF-2  43.52 
 
 
892 aa  699    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.61877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3581  translation initiation factor IF-2  64.92 
 
 
892 aa  1099    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
976 aa  723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3605  translation initiation factor IF-2  64.06 
 
 
898 aa  1110    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600034  normal  0.0461803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  62.08 
 
 
880 aa  898    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  59.48 
 
 
854 aa  766    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3993  translation initiation factor IF-2  65.03 
 
 
884 aa  1138    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116527  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  56.74 
 
 
978 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  58.33 
 
 
908 aa  690    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
965 aa  725    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  57.69 
 
 
907 aa  759    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  57.85 
 
 
968 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  57.82 
 
 
989 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  64.16 
 
 
884 aa  884    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  62.04 
 
 
896 aa  900    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1701  translation initiation factor IF-2  56.9 
 
 
991 aa  703    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  45.12 
 
 
908 aa  738    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  56.83 
 
 
979 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0631  translation initiation factor IF2-2  100 
 
 
880 aa  1795    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  62.08 
 
 
880 aa  898    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  55.84 
 
 
880 aa  956    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  64.51 
 
 
890 aa  1093    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  57.07 
 
 
971 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3544  translation initiation factor IF-2  64.92 
 
 
892 aa  1099    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  58.95 
 
 
869 aa  843    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  67.42 
 
 
894 aa  901    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  57.24 
 
 
972 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  66.07 
 
 
895 aa  1140    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  68.73 
 
 
896 aa  894    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  58.78 
 
 
831 aa  920    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1749  translation initiation factor IF-2  57.29 
 
 
890 aa  719    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0133551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  62.46 
 
 
885 aa  900    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  62.46 
 
 
885 aa  900    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  60.91 
 
 
881 aa  903    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  57.34 
 
 
969 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  56.31 
 
 
894 aa  994    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  57.24 
 
 
971 aa  720    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  56.36 
 
 
992 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  57.07 
 
 
971 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  57 
 
 
975 aa  721    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  62.08 
 
 
880 aa  898    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  56.92 
 
 
943 aa  684    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  57.07 
 
 
971 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 
962 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  51.74 
 
 
949 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  61.99 
 
 
889 aa  895    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  56.26 
 
 
920 aa  701    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  57.17 
 
 
975 aa  724    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  56.32 
 
 
964 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0721  translation initiation factor IF-2  62.23 
 
 
843 aa  766    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.467302  normal  0.0872602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3596  translation initiation factor IF-2  65.18 
 
 
892 aa  1134    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000160504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  57.31 
 
 
986 aa  724    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  67.03 
 
 
882 aa  916    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  54.71 
 
 
880 aa  956    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>