More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2829 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
153 aa  310  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  89.54 
 
 
153 aa  280  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  89.54 
 
 
153 aa  280  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  71.33 
 
 
153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  67.33 
 
 
154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  63.16 
 
 
157 aa  204  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  56.64 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  52.38 
 
 
156 aa  163  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 
164 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 
175 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  52.11 
 
 
147 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
175 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
175 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
175 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  52.67 
 
 
154 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  50 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  50 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  50 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  50 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 
174 aa  153  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 
154 aa  153  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 
157 aa  153  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 
152 aa  153  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  50 
 
 
229 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 
162 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
202 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
202 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
162 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  49.33 
 
 
229 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 
161 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 
158 aa  150  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
157 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 
155 aa  149  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 
169 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 
156 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
213 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  50.98 
 
 
161 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 
155 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 
168 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  50.98 
 
 
161 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  51.63 
 
 
161 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
181 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 
156 aa  147  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
156 aa  147  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
165 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
152 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  47.65 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 
177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  49.67 
 
 
152 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
161 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
164 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 
158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  48.99 
 
 
156 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 
153 aa  143  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
158 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
166 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
154 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
154 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 
160 aa  142  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
157 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
159 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
159 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
157 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  47.33 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
164 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  47.4 
 
 
159 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  47.02 
 
 
157 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  47.4 
 
 
169 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
152 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
152 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  46 
 
 
157 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 
169 aa  140  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  47.4 
 
 
159 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
158 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
158 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
158 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
152 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 
169 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 
158 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
154 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
154 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  46.36 
 
 
157 aa  140  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
164 aa  140  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
154 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.67 
 
 
169 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.38 
 
 
156 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 
159 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>