102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0856 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  100 
 
 
337 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  54.55 
 
 
318 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  54.55 
 
 
318 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  52.09 
 
 
320 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  54.22 
 
 
318 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  51.43 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  44.89 
 
 
327 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  44.54 
 
 
336 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  44.9 
 
 
341 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  42.72 
 
 
330 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  30.96 
 
 
339 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  32.08 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  29.55 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  31.29 
 
 
348 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  31.29 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  31.61 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  32.28 
 
 
298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  31.16 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  30.46 
 
 
476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  30.53 
 
 
300 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  31.11 
 
 
372 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  28.91 
 
 
347 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  30.86 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  29.71 
 
 
374 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  29.05 
 
 
347 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  30.94 
 
 
373 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.35 
 
 
338 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  32.93 
 
 
328 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  29.97 
 
 
439 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  28.31 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  29.84 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  27.67 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  23.72 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  30.65 
 
 
345 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  29.28 
 
 
342 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  26.71 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  32.59 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  35.2 
 
 
607 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  28.79 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  28.24 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  30.12 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  28.93 
 
 
601 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  31.73 
 
 
543 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.57 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  27.34 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  24.71 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  35.56 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  27.71 
 
 
568 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.65 
 
 
567 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  28.74 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  33.51 
 
 
526 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  27.6 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.57 
 
 
567 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  31.72 
 
 
547 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  30.15 
 
 
569 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  28.95 
 
 
546 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  30.32 
 
 
533 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  28.73 
 
 
551 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  26.72 
 
 
278 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  27.15 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  25.57 
 
 
342 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  29.38 
 
 
572 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.35 
 
 
572 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  28.81 
 
 
430 aa  56.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  31.82 
 
 
433 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  24.19 
 
 
545 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  27.94 
 
 
605 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0848  hypothetical protein  28.4 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.86 
 
 
464 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  25.36 
 
 
343 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  27.23 
 
 
449 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  34.34 
 
 
332 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  26.7 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  27.73 
 
 
542 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  25.89 
 
 
449 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  24.75 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  27.45 
 
 
570 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.93 
 
 
436 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  32.26 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.67 
 
 
600 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  30.99 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.67 
 
 
600 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  20.73 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  33.67 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  31.21 
 
 
324 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  30.07 
 
 
254 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  37.39 
 
 
308 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.16 
 
 
406 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  34.91 
 
 
426 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.26 
 
 
488 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  33.04 
 
 
309 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  31.45 
 
 
324 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  33.91 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  29.32 
 
 
498 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  28.24 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  24.87 
 
 
456 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.57 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  29.53 
 
 
498 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  24.87 
 
 
456 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4862  hypothetical protein  24.31 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0602113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>