More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  100 
 
 
247 aa  500  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  57.63 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  55.65 
 
 
263 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  52.72 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  52.81 
 
 
261 aa  247  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  45.42 
 
 
254 aa  209  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  46.64 
 
 
246 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.31 
 
 
250 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  31.95 
 
 
243 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  26.52 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  30.8 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  29.41 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  31.09 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  32.07 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.93 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  29.88 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  31.22 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.24 
 
 
393 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  26.72 
 
 
254 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.76 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  25.63 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  23.6 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  38.35 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  26.21 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.05 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  23.11 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  33.33 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  25.91 
 
 
564 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  24.1 
 
 
630 aa  70.1  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.34 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  22 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  25.94 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
391 aa  68.9  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  34 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  31.13 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  24.89 
 
 
596 aa  67  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  23.55 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.59 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.1 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  28.97 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  27.69 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  29.41 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  23.35 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  28.09 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  28.4 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  28.4 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  28.4 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  26.52 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  28.4 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  22.53 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  28.4 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  30.9 
 
 
325 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  28.4 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 
383 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  28.4 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  24.03 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  29.48 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  28.02 
 
 
385 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0377  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.93 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
393 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  31.34 
 
 
393 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  26.78 
 
 
397 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  26.36 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  31.75 
 
 
414 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  24.58 
 
 
405 aa  62.4  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.12 
 
 
592 aa  62  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  34.58 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.9 
 
 
561 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.9 
 
 
561 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
325 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  28.21 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.9 
 
 
561 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  46.03 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.7 
 
 
568 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1744  Nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  32.71 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0205  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  24.78 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.33 
 
 
374 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  25.3 
 
 
561 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
392 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  34.4 
 
 
223 aa  60.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  37.39 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.9 
 
 
561 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.8 
 
 
562 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  29.35 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  45.16 
 
 
388 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  31.71 
 
 
384 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  32.11 
 
 
326 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>