More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 312 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.26 
 
 		 310 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.08 
 
 		 309 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.32 
 
 		 310 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.23 
 
 		 310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.9 
 
 		 310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.98 
 
 		 314 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  73.38 
 
 		 309 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  73.38 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  71.43 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.1 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.62 
 
 		 306 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.9 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.6 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.3 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.85 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.63 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.51 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  38.69 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.79 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.6 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.84 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.84 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.15 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.57 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  35.74 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 		 296 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.59 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.82 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.52 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.27 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  41.4 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.15 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.27 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 		 342 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  37.5 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  43.15 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.24 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.67 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.86 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.96 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.28 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  36.27 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.97 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.33 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.863846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 357 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 		 340 aa  162  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250219 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001772  UDP-glucose 4-epimerase  33.99 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3189  polysaccharide biosynthesis protein  34.93 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.01 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 377 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  40.15 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.74 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.93 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.23 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.55 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>