More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01760 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  100 
 
 
163 aa  338  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  80 
 
 
160 aa  257  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  77.07 
 
 
188 aa  257  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  75.62 
 
 
160 aa  256  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  79.38 
 
 
161 aa  255  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  78.75 
 
 
161 aa  254  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  76.82 
 
 
164 aa  251  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  77.5 
 
 
161 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  76.16 
 
 
167 aa  249  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  78.12 
 
 
161 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  76.16 
 
 
167 aa  249  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  72.96 
 
 
166 aa  245  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  72.44 
 
 
162 aa  245  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  72.96 
 
 
166 aa  245  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  75 
 
 
169 aa  244  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  72.08 
 
 
161 aa  240  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  70.32 
 
 
168 aa  236  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  68.79 
 
 
166 aa  235  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  68.79 
 
 
166 aa  235  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  78.12 
 
 
161 aa  234  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  78.12 
 
 
161 aa  234  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  70.39 
 
 
161 aa  233  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  65.64 
 
 
168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  73.29 
 
 
161 aa  231  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  66.25 
 
 
167 aa  230  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  69.03 
 
 
168 aa  229  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  71.61 
 
 
162 aa  221  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  63.19 
 
 
178 aa  218  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  66.22 
 
 
171 aa  213  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  65.07 
 
 
188 aa  204  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  65.61 
 
 
180 aa  203  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  58.9 
 
 
187 aa  202  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  68.38 
 
 
178 aa  198  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  63.33 
 
 
167 aa  198  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  67.57 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  67.33 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 
162 aa  190  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  66.19 
 
 
161 aa  190  9e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  55.48 
 
 
185 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  55.84 
 
 
187 aa  181  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  56.85 
 
 
146 aa  180  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  54.61 
 
 
173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 
179 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 
176 aa  174  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  48.32 
 
 
189 aa  161  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  45.7 
 
 
180 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  45.86 
 
 
187 aa  160  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  51.8 
 
 
169 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  48 
 
 
182 aa  157  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  47.4 
 
 
185 aa  154  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  42.66 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
155 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  37.89 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  38.71 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  45.89 
 
 
167 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.54 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  48 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 
158 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  43.08 
 
 
248 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  42.76 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  36.55 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  36.42 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  37.32 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.11 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
175 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  36.55 
 
 
162 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.76 
 
 
159 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  38.36 
 
 
168 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
158 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 
161 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 
168 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  39.31 
 
 
170 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
147 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  44.44 
 
 
163 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  43.59 
 
 
163 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
172 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0878  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
172 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
162 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
327 aa  99.4  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  38.27 
 
 
162 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 
165 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 
170 aa  97.1  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  37.24 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.57 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>