212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5968 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  60.39 
 
 		 210 aa  262  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  61.35 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  64.36 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  51.27 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0072  putative fructose transport system kinase  50.25 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  50.76 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3564  hypothetical protein  49 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  50.51 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  51.26 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  50.51 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  48.37 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  46.8 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0502  hypothetical protein  46.27 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38330  hypothetical protein  37.25 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  38.89 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0716  putative fructose transport system kinase  40 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0988  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.83 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0166528  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  40.5 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1238  putative fructose transport system kinase  39.49 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3839  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.94 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  37.44 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2086  putative fructose transport system kinase  38.92 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2554  putative fructose transport system kinase  37.25 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.62572 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2867  putative fructose transport system kinase  38.1 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3554  putative fructose transport system kinase  35.29 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2550  putative fructose transport system kinase  36.76 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3493  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.9 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2803  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  37.88 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.700623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3270  putative fructose transport system kinase  39.11 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587247  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4807  putative fructose transport system kinase  39.89 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4825  putative fructose transport system kinase  38.54 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3768  phosphoribulokinase/uridine kinase  37.04 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05970  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3316  putative fructose transport system kinase  35.38 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47307  pantothenate kinase-like protein  33.33 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3249  putative fructose transport system kinase  34.91 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.545767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2255  hypothetical protein  37.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  0.941975 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001416  uridine kinase  34.43 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.922177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  40.94 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.69 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  34.69 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1817  hypothetical protein  35.08 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3357  putative fructose transport system kinase  35.23 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2601  putative fructose transport system kinase  37.11 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.208404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3262  putative fructose transport system kinase  35.23 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.658229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4229  putative fructose transport system kinase  36.08 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3755  hypothetical protein  32.84 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3069  putative fructose transport system kinase  35.23 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4137  hypothetical protein  34.62 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1720  phosphoribulokinase/uridine kinase  38.73 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02759  hypothetical protein  34.9 
 
 		 237 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.505091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0765  putative fructose transport system kinase  34.9 
 
 		 237 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0782  putative fructose transport system kinase  34.9 
 
 		 237 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02722  hypothetical protein  34.9 
 
 		 237 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.455616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3086  putative fructose transport system kinase  34.9 
 
 		 237 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.949121  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  32.39 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0781  hypothetical protein  37.89 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88056  predicted protein  34.63 
 
 		 261 aa  95.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  31.07 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.02 
 
 		 234 aa  89.4  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0848  hypothetical protein  37.43 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  30.89 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 		 583 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2606  pantothenate kinase  35.8 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  32.05 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  32.05 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0666  pantothenate kinase  33.14 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.755072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  33.12 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4274  pantothenate kinase  35.71 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02590  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29310  pantothenate kinase  31.03 
 
 		 316 aa  78.2  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2721  pantothenate kinase  34.75 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  33.1 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15134  predicted protein  32.72 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23200  pantothenate kinase  31.61 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  32.41 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0723  pantothenate kinase  37.59 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  41.67 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2317  pantothenate kinase  30.67 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0791342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  32.41 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  30.26 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00238  pantothenate kinase  29.78 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4148  pantothenate kinase  30.72 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2718  pantothenate kinase  36.11 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5036  pantothenate kinase  44.94 
 
 		 309 aa  72  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0328  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 316 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.126944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3395  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 316 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0824651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3870  pantothenate kinase  28.12 
 
 		 316 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000776602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07340  pantothenate kinase  32.05 
 
 		 316 aa  71.6  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.325871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0269  pantothenate kinase  27.67 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000212467  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002164  pantothenate kinase  26.82 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000565373  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16790  pantothenate kinase  31.97 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0359  pantothenate kinase  23.9 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0895  pantothenate kinase  32.62 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  32.64 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  32.64 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  32.64 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  28.41 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  28.37 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>