More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0392 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  100 
 
 		 301 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  66.32 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  63 
 
 		 319 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  60.88 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.18 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  60.75 
 
 		 319 aa  308  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  53.58 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  58.72 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  49.29 
 
 		 314 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.83 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  49.32 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  48.99 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.82 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  46.23 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  44.9 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  39.93 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  46.69 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  46.13 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.3 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.81 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.97 
 
 		 304 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  37.5 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  37.11 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.26 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.26 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  35.92 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  38.95 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  34.87 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  39.78 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  33 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  37.41 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  36.04 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  31.13 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  35.02 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  37.29 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  34.34 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  37.89 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  30.14 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  34.31 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  35.36 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  34.7 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  31.42 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  32.09 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  36.84 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  33.89 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  31.4 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  32.76 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  31.61 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  34.28 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  32.03 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  28.28 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  32.51 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.23 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  31.62 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  31.35 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  31.35 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  31.35 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.17 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  31.35 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  37.05 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.05 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  37.05 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  32.39 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  30.46 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  31.35 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  31.35 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  31.02 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  35.97 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  29.47 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  29.47 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  29.87 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  33.67 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  32.39 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  25.26 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  30.69 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  33.57 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  29.23 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  29.53 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  30.58 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  28.98 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  32.53 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  36.44 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0431  hypothetical protein  58.33 
 
 		 92 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  28.66 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  29.37 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.13 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  23.49 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  23.97 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>