More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3287 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  100 
 
 		 492 aa  963    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  68.36 
 
 		 478 aa  658    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  45.1 
 
 		 551 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  45.41 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  43.74 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  45.2 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  42.63 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  43.2 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  36.67 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 508 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  35.1 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  29.45 
 
 		 357 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  22.56 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 351 aa  93.2  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08781  hypothetical protein  23.73 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  27.12 
 
 		 356 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  24.94 
 
 		 580 aa  90.1  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 948 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  33.17 
 
 		 243 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  28.97 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 803 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  24.48 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  26.51 
 
 		 700 aa  84  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  23.99 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  24.27 
 
 		 897 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.39 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.17 
 
 		 781 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  22.81 
 
 		 1055 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  34.39 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  22.33 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  23.02 
 
 		 576 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 931 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  25.57 
 
 		 869 aa  77.8  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  33.15 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  27.39 
 
 		 922 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  23.33 
 
 		 936 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  30.21 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.8 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.8 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.8 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.8 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  24 
 
 		 827 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.8 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 915 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  29.44 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  27.31 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  29.51 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 920 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.64 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25.33 
 
 		 919 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  23.72 
 
 		 277 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 910 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  25.46 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  27.37 
 
 		 577 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  30.35 
 
 		 252 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  25.99 
 
 		 264 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  28 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  30.68 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  25.38 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.75 
 
 		 703 aa  71.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  35.34 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  25.83 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.13 
 
 		 919 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  23.88 
 
 		 833 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  24.56 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 912 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 		 921 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  25.52 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  31.75 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  23.52 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  28.63 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  30.93 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  22.77 
 
 		 869 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  24.4 
 
 		 264 aa  69.3  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  24.76 
 
 		 992 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  31.75 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  24.83 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  27.97 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  30.69 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  22.67 
 
 		 852 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 185 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.69 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.69 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.69 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  30.69 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.69 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>