More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1813 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  68.75 
 
 		 183 aa  248  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  64.2 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  62.78 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  62.5 
 
 		 184 aa  231  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  62.22 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  61.11 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  59.32 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  59.78 
 
 		 184 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  59.44 
 
 		 185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  59.34 
 
 		 187 aa  224  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 185 aa  222  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  58.89 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  58.33 
 
 		 185 aa  221  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  59.89 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  58.15 
 
 		 185 aa  220  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  57.78 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  57.78 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2625  ribosome recycling factor  60.87 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000230935  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  56.5 
 
 		 185 aa  217  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  55.56 
 
 		 185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  56.5 
 
 		 186 aa  213  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  55.98 
 
 		 184 aa  213  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  58.19 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  57.69 
 
 		 185 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  54.95 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  54.24 
 
 		 186 aa  210  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2221  ribosome recycling factor  55.37 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0750591  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4123  ribosome recycling factor  54.24 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  56.25 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  56.5 
 
 		 184 aa  208  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 184 aa  208  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1985  ribosome recycling factor  54.24 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2004  ribosome recycling factor  54.24 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2050  ribosome recycling factor  54.24 
 
 		 185 aa  207  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  54.35 
 
 		 184 aa  207  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2111  ribosome recycling factor  54.24 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  52.75 
 
 		 185 aa  207  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  53.67 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  53.67 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  54.91 
 
 		 185 aa  204  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  54.8 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  54.8 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  52.87 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0708  ribosome recycling factor  54.8 
 
 		 181 aa  202  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000756586  unclonable  0.0000000210923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0389  ribosome recycling factor  55.62 
 
 		 187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  55 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  53.67 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 182 aa  197  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  54.02 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  52.84 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  52.27 
 
 		 182 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  56.25 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1901  ribosome recycling factor  53.85 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.782843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1183  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  52.27 
 
 		 182 aa  195  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  53.41 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  52.84 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  52.17 
 
 		 186 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  51.41 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0241  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3240  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  54.6 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 186 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  53.67 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  191  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  53.11 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1866  ribosome recycling factor  51.98 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  52.54 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>