More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3075 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  813    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  80.76 
 
 		 423 aa  673    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  57.08 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  56.42 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  48.87 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  54.85 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  53.15 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  45.76 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  42.04 
 
 		 445 aa  292  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  44.2 
 
 		 415 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  46.72 
 
 		 408 aa  275  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  44.26 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 422 aa  270  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  47.76 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 443 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  42.64 
 
 		 505 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 422 aa  252  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  42.18 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  46.11 
 
 		 430 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  44.34 
 
 		 430 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  49.35 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  38.46 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 426 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  37.12 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  32.21 
 
 		 404 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  32.75 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 415 aa  160  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  29.87 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  28.24 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  27.91 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  28.68 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 416 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  26.5 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  27.3 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  30.21 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 420 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  29.46 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29.95 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  26.5 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 440 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  27.2 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 427 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  23.93 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  35.02 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  28.64 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 403 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  29.41 
 
 		 542 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 418 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 416 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  29.65 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  29.78 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  27.51 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  29.26 
 
 		 549 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  27.47 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>