More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1145 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  100 
 
 
182 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  44.38 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  45.39 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  43.82 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  43.82 
 
 
166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  40.68 
 
 
166 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  40.11 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  40.11 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 
177 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  39.55 
 
 
166 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  37.22 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  39.23 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  37.21 
 
 
173 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.07 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 
166 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  36.21 
 
 
166 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  36.21 
 
 
166 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 
174 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  37.11 
 
 
165 aa  102  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 
166 aa  101  5e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  35.8 
 
 
181 aa  101  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  37.08 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  33.92 
 
 
172 aa  98.6  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  34.91 
 
 
175 aa  97.4  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  37.16 
 
 
164 aa  96.7  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  31.79 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  35.56 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  35.63 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  35.12 
 
 
173 aa  94.4  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  33.14 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 
174 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 
173 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 
173 aa  91.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 
173 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  34.59 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  30.95 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  33.91 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  30.11 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 
174 aa  87.8  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  32.35 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  31.98 
 
 
174 aa  87  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  29.75 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  28.07 
 
 
174 aa  84.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  32.95 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  35.86 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  32 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  34.88 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  32 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  32 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  33.54 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  30.46 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  31.28 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  31.32 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  31.03 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  31.9 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  27.17 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  32.53 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  28.07 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  31.79 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  32.95 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  31.71 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  30.99 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  28.49 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  33.91 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  29.07 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  27.17 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  31.98 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  29.31 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0234  ribosomal protein L10  32.39 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.675629  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  29.65 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  28.74 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>