More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0271 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 347 aa  716    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  63.09 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  60.44 
 
 		 372 aa  424  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  61.34 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  57 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  54.87 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  50.48 
 
 		 351 aa  332  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  49.84 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  49.37 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  49.05 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  48.11 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  47.47 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  46.32 
 
 		 349 aa  292  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  47.27 
 
 		 349 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  43.7 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  45.37 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  44.81 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  43.09 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  45.74 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  43.67 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  40.42 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  43.31 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  42.34 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  42.68 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  43.33 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  39.82 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  41.8 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  40.64 
 
 		 357 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  43.7 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  43.66 
 
 		 370 aa  235  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  40.07 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  40.49 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  42.14 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  38.38 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  38.72 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  38.89 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  32.06 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  31.88 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.46 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  29.41 
 
 		 475 aa  97.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  28.57 
 
 		 474 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.07 
 
 		 473 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.46 
 
 		 470 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.69 
 
 		 473 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.08 
 
 		 477 aa  86.3  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  27 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.82 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.86 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.52 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.76 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.85 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.85 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.45 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.65 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.81 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.38 
 
 		 469 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.59 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.76 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.65 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.78 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.69 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.57 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.48 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.31 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.62 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  29.57 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.9 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  27.49 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  27.49 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.33 
 
 		 479 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  27.49 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  27.86 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.53 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  28.07 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.54 
 
 		 467 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.74 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  25.31 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.79 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.9 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.92 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.81 
 
 		 465 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  26.3 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  26.1 
 
 		 335 aa  65.9  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  23.29 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.93 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.93 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.93 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  27.23 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.27 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  25 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  25 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  30.97 
 
 		 836 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  26.86 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  25.1 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>