49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2482 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  100 
 
 
65 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  75.76 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  75.76 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1304  FmdB family regulatory protein  43.86 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00793383  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2774  regulatory protein, FmdB family  44.26 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2620  hypothetical protein  45 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  41.79 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  48.98 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0086  regulatory protein, FmdB family  32.76 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.576483  hitchhiker  0.00282506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 
125 aa  48.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  49.02 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  44 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  52.27 
 
 
99 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  38.33 
 
 
80 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1775  FmdB family regulatory protein  40.98 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  43.14 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  41.38 
 
 
76 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  48.15 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0773  regulatory protein, FmdB family  35.56 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  42.59 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  57.14 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  32.31 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2281  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  39.62 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  40.85 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  41.82 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  44.83 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0687  regulatory protein, FmdB family  46.51 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406646  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2544  FmdB family regulatory protein  50 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278642  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  38.46 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  46.15 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1259  hypothetical protein  39.66 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  41.51 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  47.73 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  47.73 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2776  FmdB family regulatory protein  40.35 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  48.94 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  40 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  41.86 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  41.86 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1596  hypothetical protein  29.31 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000473565  normal  0.661888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  43.1 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  43.18 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1172  FmdB family regulatory protein  43.48 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  37.5 
 
 
77 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  42 
 
 
181 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>