More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6643 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 413 aa  826    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  73.16 
 
 		 406 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  72.8 
 
 		 411 aa  586  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  71.11 
 
 		 405 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  73.23 
 
 		 402 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  74.94 
 
 		 412 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  71.36 
 
 		 415 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  72.13 
 
 		 415 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  71.78 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  71.79 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  67.16 
 
 		 410 aa  558  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  72.11 
 
 		 401 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  71.36 
 
 		 402 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  72.15 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  70 
 
 		 415 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  69.35 
 
 		 401 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  67.81 
 
 		 409 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  69.1 
 
 		 402 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  64.22 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  67.09 
 
 		 402 aa  532  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  67.33 
 
 		 405 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  60.26 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  57.11 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  53.65 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.84 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  45.59 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  48.11 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  48.37 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  47.84 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  45.25 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  44.28 
 
 		 399 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  49.62 
 
 		 390 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  44.02 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 		 389 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.98 
 
 		 396 aa  354  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  43.18 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  46.27 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  45.55 
 
 		 388 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  44.27 
 
 		 393 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  40.91 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  45.84 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  45.04 
 
 		 390 aa  342  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 		 400 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 		 400 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  44.72 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  46.25 
 
 		 404 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 		 395 aa  339  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  45.25 
 
 		 400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  43.18 
 
 		 392 aa  339  7e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.42 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  42.21 
 
 		 389 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  44.17 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  46.43 
 
 		 390 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  44.22 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  41.22 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  45.62 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  43.65 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  42.53 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  40.71 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  40.97 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  44.7 
 
 		 397 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  44.22 
 
 		 400 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  44.25 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  40.66 
 
 		 397 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  41.98 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  44.97 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  41.56 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  42.03 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  45.29 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 		 396 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  44.64 
 
 		 400 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  41.73 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  43.99 
 
 		 400 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  41 
 
 		 398 aa  325  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 		 397 aa  325  7e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  39.65 
 
 		 397 aa  324  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  42.07 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  42.18 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  43 
 
 		 400 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  43.11 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 		 388 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  42 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  43.48 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8484  aminotransferase class I and II  43.18 
 
 		 409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  40.69 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  41.92 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>