More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5905 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 245 aa  477  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  61.92 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  53.99 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0607  Methyltransferase type 11  53.74 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0317201  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4465  Methyltransferase type 11  52.4 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0472  methyltransferase type 11  51.83 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3411  type 11 methyltransferase  50.93 
 
 		 232 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.58 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.96 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  39.62 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  31.54 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  43.3 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  43.3 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  30.6 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.62 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 208 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.03 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 1005 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 1106 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  29.85 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.88 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  37.39 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.06 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  37.61 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.88 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  39.22 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.71 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  37 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.88 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  38 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.88 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.39 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  32.85 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  27.97 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.88 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 1002 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.87 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.97 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  38.14 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  29.76 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  28.67 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  35.39 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.54 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2671  SAM-dependent methyltransferase  28.45 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>