More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4704 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 478 aa  926    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  63.09 
 
 		 472 aa  504  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  58.65 
 
 		 489 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  56.74 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  47.43 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 		 508 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 500 aa  266  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.99 
 
 		 498 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 487 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.67 
 
 		 487 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5620  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000613899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.28 
 
 		 763 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  36.32 
 
 		 470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 481 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  35.92 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  34.07 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  34.38 
 
 		 481 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.96 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 470 aa  200  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.32 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4526  efflux transporter  46.95 
 
 		 303 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344651  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.46 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 522 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 		 553 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  37.47 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.07 
 
 		 1112 aa  189  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 		 519 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 		 534 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 471 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.18 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  32.51 
 
 		 497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 490 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 482 aa  183  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 		 479 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  39.03 
 
 		 489 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 		 493 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 		 500 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 		 472 aa  179  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  34.73 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.92 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 		 757 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  36.87 
 
 		 505 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 487 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1035  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 466 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.87 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  34.04 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.05 
 
 		 484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.98 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 		 478 aa  173  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 		 487 aa  173  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.12 
 
 		 506 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.56 
 
 		 500 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 487 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 788 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  28.38 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 733 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.84 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 473 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0901  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  31.01 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.92 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  34.38 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 500 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 		 478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  30.17 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.53 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.49 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 480 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 506 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  32.86 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.2 
 
 		 478 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>