More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4684 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 526 aa  1062    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  54.58 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.58 
 
 		 556 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.58 
 
 		 556 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.58 
 
 		 556 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.42 
 
 		 579 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  54.34 
 
 		 525 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  53.91 
 
 		 534 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53 
 
 		 570 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.36 
 
 		 554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  50.39 
 
 		 527 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  48.32 
 
 		 1043 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  45.36 
 
 		 520 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  40.82 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.06 
 
 		 529 aa  319  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.58 
 
 		 503 aa  316  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.57 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.57 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.57 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 		 501 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  41.16 
 
 		 518 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  41.58 
 
 		 532 aa  309  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 		 530 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 515 aa  306  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  40.8 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 508 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  39.88 
 
 		 514 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  40.42 
 
 		 513 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 509 aa  296  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  38.46 
 
 		 520 aa  295  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 540 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 516 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 518 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.33 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 496 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 518 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 515 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 515 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 501 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 496 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.97 
 
 		 519 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 518 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  40.28 
 
 		 534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 505 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 506 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 524 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 496 aa  286  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 496 aa  286  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  35.87 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 518 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 		 514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 520 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  39.36 
 
 		 551 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 		 525 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 		 526 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  37.67 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.58 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 523 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  37.87 
 
 		 490 aa  279  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 		 532 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 509 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 518 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 519 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 520 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 511 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 		 553 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 518 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 541 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 		 526 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 520 aa  272  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 502 aa  270  4e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 		 525 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 530 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 662 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 522 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 520 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 515 aa  270  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 520 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 506 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 		 525 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.64 
 
 		 525 aa  266  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  33.8 
 
 		 522 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.04 
 
 		 525 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  37.18 
 
 		 521 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 630 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34 
 
 		 481 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 551 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 512 aa  263  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  35.01 
 
 		 504 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.97 
 
 		 530 aa  262  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 522 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>