More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2577 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 346 aa  694    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  51.03 
 
 		 359 aa  315  9e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  52.42 
 
 		 352 aa  298  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  45.54 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  46.4 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  48.45 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  45.16 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  44.14 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  47.51 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  46.22 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  44.28 
 
 		 348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  44.74 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  46.73 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  43.64 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  43.6 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  42.5 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  43.16 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  42.77 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  43.47 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  43.44 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  42.25 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  44.91 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  45.51 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  43.11 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 		 359 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  41.25 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  39.48 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  38.72 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  42.95 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0817  transcriptional regulator, LacI family  38.3 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.533751  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  37.35 
 
 		 358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  36.75 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  36.25 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  36.67 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  36.14 
 
 		 355 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  36.36 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  36.06 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  36.06 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  36.06 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  36.06 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  34.29 
 
 		 343 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  36.06 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  36.06 
 
 		 363 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  32.85 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  36.06 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  33.84 
 
 		 357 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  33.84 
 
 		 357 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  33.84 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  36.17 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  33.23 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.69 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.21 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  33.73 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.94 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.1 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  34.41 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.19 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  30.89 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0572  LacI family response repressor  33.44 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.379149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.95 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  37.11 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  35.21 
 
 		 333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  34.9 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  29.85 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.47 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  33.24 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0256  regulatory protein, LacI  31.21 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0262  regulatory protein LacI  31.21 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  35.57 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 362 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.62 
 
 		 343 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  28.45 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1459  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  36.26 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  30.48 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>