More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3855 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  98.28 
 
 		 348 aa  691    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  78.62 
 
 		 390 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  35.96 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  36.8 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  35.59 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.54 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  35.14 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  37.46 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  35.71 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  35.97 
 
 		 826 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  36.16 
 
 		 517 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  32.56 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  35.55 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.24 
 
 		 751 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  33.89 
 
 		 267 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  31.88 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.8 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.82 
 
 		 433 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.99 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  39.78 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  33.78 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.63 
 
 		 517 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.57 
 
 		 742 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  30.87 
 
 		 952 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.03 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  32.36 
 
 		 668 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  32.25 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  32.09 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.43 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  33.11 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.08 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  35.43 
 
 		 600 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  35.64 
 
 		 549 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  32.59 
 
 		 551 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  31.83 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.55 
 
 		 446 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  31.79 
 
 		 829 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  32.01 
 
 		 587 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.05 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 		 276 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  31.37 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  33.99 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  31.46 
 
 		 303 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  34.91 
 
 		 556 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  31.35 
 
 		 246 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  36.12 
 
 		 628 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1911 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  30.79 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  31.46 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  30.79 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  33.14 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  33.08 
 
 		 605 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1581 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  28.9 
 
 		 654 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  27.94 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  27.13 
 
 		 346 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  31.23 
 
 		 359 aa  119  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  31.42 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  31.66 
 
 		 768 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  30.36 
 
 		 922 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  32.56 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  29.14 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  30.59 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  30.72 
 
 		 877 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 		 538 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  28 
 
 		 288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  32.42 
 
 		 624 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  31.44 
 
 		 384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1711  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 		 1043 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.610631  normal  0.122083 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.06 
 
 		 614 aa  113  5e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  32.59 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  28.53 
 
 		 584 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.27 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  30.59 
 
 		 664 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  30.5 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  30.62 
 
 		 527 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2927  hypothetical protein  27.45 
 
 		 248 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  31.36 
 
 		 611 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  30.65 
 
 		 1160 aa  109  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  31.39 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  32.79 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  30.62 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  34.08 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  33.78 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  35.17 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  31.39 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3063  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  0.329072 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  33.73 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 		 882 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  29.75 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  30.81 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 616 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  31.77 
 
 		 740 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>