More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2927 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2927  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3178  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  28.24 
 
 
348 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  32.6 
 
 
359 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  27.45 
 
 
348 aa  109  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  28.24 
 
 
390 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.62 
 
 
826 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  36.2 
 
 
433 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.59 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 
323 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  26.81 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  32.61 
 
 
586 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  40.88 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.42 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  37.14 
 
 
398 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 
319 aa  94  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
336 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  30.49 
 
 
321 aa  92.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 
829 aa  92.4  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 
398 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.14 
 
 
751 aa  91.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  29.17 
 
 
358 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
637 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  43.48 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  31.42 
 
 
668 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
509 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  30.37 
 
 
336 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  36.84 
 
 
401 aa  86.3  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  27.52 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  29.18 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  38.46 
 
 
214 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  26.53 
 
 
1160 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  39.23 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  25.88 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  34.71 
 
 
517 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  33.11 
 
 
327 aa  82  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  37.93 
 
 
538 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  36.43 
 
 
224 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  29.67 
 
 
384 aa  81.6  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  28.52 
 
 
324 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  29.02 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  28.07 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  38.39 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  25.91 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  26.91 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  51.9 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  35.38 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  28.07 
 
 
600 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  27.59 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  24.81 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  37.21 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.47 
 
 
517 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  31.51 
 
 
892 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  36 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  27.45 
 
 
351 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  29.17 
 
 
284 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  38.02 
 
 
742 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  27.4 
 
 
611 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  38.74 
 
 
664 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
715 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.61 
 
 
587 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.39 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
768 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  36.89 
 
 
603 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  35.07 
 
 
781 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  39.47 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  28.63 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  25.73 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  39.05 
 
 
820 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  26.75 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  38.89 
 
 
925 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  26.09 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  26.34 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  28.24 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  34.78 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  38.02 
 
 
636 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  26.22 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  26.34 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  37.19 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  29.17 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
639 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  32 
 
 
605 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  38.89 
 
 
522 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
639 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  29.78 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  41.18 
 
 
862 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 
616 aa  75.1  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  35.25 
 
 
287 aa  75.1  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  28.29 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  42.16 
 
 
1911 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  40.38 
 
 
929 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  27.39 
 
 
556 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 
628 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  29.11 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  32.85 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>