More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0399 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 214 aa  421  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  56.52 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  55.07 
 
 		 216 aa  204  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  57.84 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  53.88 
 
 		 248 aa  202  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  55.67 
 
 		 221 aa  201  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  59.46 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  52.43 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  53.92 
 
 		 232 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  57.81 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  55.56 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  51.92 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2686  ribosomal protein L4/L1e  58.7 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  53.59 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  57.3 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  54.41 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  56.76 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  56.76 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  56.76 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  52.94 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  54.77 
 
 		 292 aa  191  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2974  50S ribosomal protein L4P  58.15 
 
 		 205 aa  191  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  51.2 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  56.02 
 
 		 247 aa  188  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4320  ribosomal protein L4/L1e  52.6 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  52.88 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  54.45 
 
 		 245 aa  184  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1186  50S ribosomal protein L4/L1e  53.17 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  56.22 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0588  ribosomal protein L4/L1e  53.59 
 
 		 228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.290054  normal  0.451966 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  55.43 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  50.75 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  49.51 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23800  50S ribosomal protein L4  51.94 
 
 		 312 aa  168  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1708  50S ribosomal protein L4  48.8 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00274066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  44.61 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3757  ribosomal protein L4/L1e  53.23 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6613  ribosomal protein L4/L1e  53.17 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3904  50S ribosomal protein L4P  52.26 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  45.59 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0256  ribosomal protein L4/L1 family protein  44.5 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  45.73 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  43.63 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  43.72 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  40.87 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  46.19 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  39.52 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  44.61 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  42.65 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  40.95 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  40.59 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  40 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  41.18 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2173  50S ribosomal protein L4  44.2 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000174601  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  43.81 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  40.2 
 
 		 207 aa  144  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  39.71 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  41.43 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  41.71 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0872  50S ribosomal protein L4  42.33 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  37.75 
 
 		 207 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  41 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  39.22 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  39.41 
 
 		 205 aa  141  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0321  50S ribosomal protein L4  43.65 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0789186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  40.7 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  40.98 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3821  50S ribosomal protein L4  42.54 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  43.58 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  41.5 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  41.54 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0394  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000249214  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3750  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000124791  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3635  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03121  hypothetical protein  41.99 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000877437  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3704  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3802  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>