More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0389 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  329  1e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  44.05 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  50.91 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  45.29 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  44.05 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  42.35 
 
 		 175 aa  135  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  44.64 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  47.47 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  47.8 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  45.83 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  45.24 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  42.53 
 
 		 176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  48.17 
 
 		 173 aa  130  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  43.53 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  40.24 
 
 		 172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  44.3 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.51 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  47.56 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  44.12 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  45.39 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  46.47 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  45.75 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  45.73 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  48.89 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  46.05 
 
 		 228 aa  121  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  44.51 
 
 		 181 aa  121  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  40.24 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  40.62 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  45.39 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.76 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  42.26 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  42.48 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  44.31 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  41.88 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  46.71 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  41.76 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  46.32 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  39.76 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  42.35 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  39.02 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  30.77 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  40.24 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  33.13 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>