More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0924 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1889  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  65.2 
 
 
591 aa  822    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000177663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
590 aa  1213    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02120  adenylylsulfate reductase subunit alpha  46.67 
 
 
574 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0788  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  41.75 
 
 
579 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1710  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.2 
 
 
594 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1830  adenylylsulfate reductase subunit alpha  38.58 
 
 
566 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1191  adenylylsulfate reductase subunit alpha  38.66 
 
 
563 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1048  adenylylsulfate reductase subunit alpha  34.12 
 
 
634 aa  360  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0255965  normal  0.0162611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1080  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.91 
 
 
635 aa  340  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3577  adenylylsulfate reductase subunit alpha  34.3 
 
 
625 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000483589  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0273  adenylylsulfate reductase subunit alpha  34.91 
 
 
635 aa  335  2e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.00000000319347  hitchhiker  0.0000001391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1885  adenylylsulfate reductase subunit alpha  35.73 
 
 
629 aa  335  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00911706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0998  adenylylsulfate reductase subunit alpha  33.18 
 
 
659 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000010424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3198  adenylylsulfate reductase subunit alpha  34.51 
 
 
663 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000352538  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0039  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.35 
 
 
658 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0540157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1966  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.15 
 
 
667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1837  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.2 
 
 
658 aa  327  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000390023  normal  0.0111603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1585  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.58 
 
 
657 aa  325  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000155329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0065  adenylylsulfate reductase, alpha subunit  33.17 
 
 
632 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.683279  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0637  adenylylsulfate reductase subunit alpha  35.82 
 
 
624 aa  323  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2129  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.04 
 
 
662 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2893  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.45 
 
 
665 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.127343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2136  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.45 
 
 
664 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.290576  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2282  adenylylsulfate reductase subunit alpha  32.68 
 
 
622 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1110  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.42 
 
 
664 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0350  adenylylsulfate reductase subunit alpha  33.17 
 
 
622 aa  318  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.823555  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1235  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.99 
 
 
629 aa  311  2e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1428  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.94 
 
 
627 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0872  adenylylsulfate reductase subunit alpha  31.92 
 
 
673 aa  290  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4067  putative oxidoreductase  28.5 
 
 
569 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.594531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.08 
 
 
556 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  26.77 
 
 
574 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  26.77 
 
 
574 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  27.06 
 
 
574 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  27.57 
 
 
582 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  27.35 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  26.63 
 
 
576 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  27.5 
 
 
580 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3676  putative oxidoreductase  27.23 
 
 
582 aa  170  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1887  putative oxidoreductase  26.97 
 
 
579 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217811  normal  0.846517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5287  putative oxidoreductase  27.26 
 
 
579 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0886566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  26.13 
 
 
578 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1960  putative oxidoreductase  26.97 
 
 
579 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0205  putative oxidoreductase  27.35 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321427  normal  0.765338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  26.9 
 
 
579 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  26.42 
 
 
578 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1478  putative oxidoreductase  26.6 
 
 
591 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4196  putative oxidoreductase  26.5 
 
 
580 aa  160  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.616255  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  25.17 
 
 
578 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  26.38 
 
 
574 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  26.9 
 
 
573 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1996  putative oxidoreductase  26.25 
 
 
579 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3785  putative oxidoreductase/HEAT repeat-containing protein  28.4 
 
 
954 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824517  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1972  putative oxidoreductase  26.25 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6105  putative oxidoreductase  26.07 
 
 
579 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.36 
 
 
610 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.9 
 
 
598 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  23.8 
 
 
573 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  27.84 
 
 
576 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.78 
 
 
575 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  26.67 
 
 
575 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  23.21 
 
 
582 aa  94.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3522  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.06 
 
 
564 aa  93.2  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000707251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.13 
 
 
575 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.13 
 
 
575 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.48 
 
 
575 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  22.56 
 
 
584 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.9 
 
 
578 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  22.71 
 
 
596 aa  81.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.05 
 
 
588 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.04 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  25.87 
 
 
542 aa  79  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.39 
 
 
598 aa  79  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.6 
 
 
575 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  22.62 
 
 
584 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  23.76 
 
 
587 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1142  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.78 
 
 
589 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.881943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22.88 
 
 
638 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  22.2 
 
 
568 aa  77.8  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2916  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.93 
 
 
588 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.8 
 
 
570 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0785  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.2 
 
 
576 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.13 
 
 
566 aa  75.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.26 
 
 
566 aa  75.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  22.75 
 
 
570 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  21.86 
 
 
596 aa  75.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1388  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.08 
 
 
580 aa  75.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.394605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.84 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.41 
 
 
577 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.4 
 
 
588 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.82 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22 
 
 
584 aa  74.3  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.43 
 
 
587 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0887  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  22 
 
 
583 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2084  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.88 
 
 
601 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.774192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  24.4 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.39 
 
 
591 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.6 
 
 
563 aa  71.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.02 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.08 
 
 
540 aa  70.5  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>