190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3904 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3904  Sel1  100 
 
 
571 aa  1151    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190521  decreased coverage  0.00495215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  35.78 
 
 
241 aa  65.1  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.26 
 
 
225 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  39.74 
 
 
373 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  39.74 
 
 
373 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.26 
 
 
231 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35 
 
 
684 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  40.26 
 
 
235 aa  60.5  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.62 
 
 
2413 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.05 
 
 
416 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  43.9 
 
 
376 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  39.76 
 
 
254 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  39.51 
 
 
961 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  40.96 
 
 
232 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2048  putative multiprotein complex assembly protein  32.84 
 
 
229 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.373399  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.55 
 
 
789 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  26.37 
 
 
271 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  35.44 
 
 
221 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 
831 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.78 
 
 
1037 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.45 
 
 
482 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.66 
 
 
489 aa  57.4  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  42.68 
 
 
376 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
252 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.25 
 
 
246 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  36.94 
 
 
269 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.96 
 
 
223 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3355  Sel1 repeat-containing protein  31.54 
 
 
147 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355214  normal  0.280388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  27.32 
 
 
1493 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.47 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  34.04 
 
 
115 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.96 
 
 
256 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.96 
 
 
329 aa  55.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  35.9 
 
 
403 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.04 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.11 
 
 
961 aa  54.7  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.36 
 
 
1402 aa  54.7  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  31.75 
 
 
155 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  39.76 
 
 
202 aa  54.7  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  33.04 
 
 
267 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.66 
 
 
448 aa  54.3  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  54.7  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.9 
 
 
1002 aa  54.3  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  39.56 
 
 
490 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  39.56 
 
 
490 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
976 aa  53.9  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.14 
 
 
343 aa  53.9  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1358  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.64 
 
 
258 aa  53.9  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.177099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  36.04 
 
 
328 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  33.61 
 
 
208 aa  53.9  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2610  hypothetical protein  42.67 
 
 
175 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 
528 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  40.96 
 
 
342 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  34 
 
 
720 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  31.25 
 
 
273 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
1032 aa  53.5  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.27 
 
 
890 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  37.14 
 
 
218 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  37.96 
 
 
315 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  35.06 
 
 
415 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  34 
 
 
720 aa  53.5  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  34 
 
 
720 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  32.14 
 
 
256 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  30.36 
 
 
273 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  33.04 
 
 
273 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  34.18 
 
 
1141 aa  52.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.77 
 
 
359 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 
172 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.66 
 
 
190 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
303 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.87 
 
 
425 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.96 
 
 
274 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  39.51 
 
 
464 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  30.32 
 
 
234 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.191842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  30.1 
 
 
311 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  30.1 
 
 
301 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.81 
 
 
1260 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.35 
 
 
565 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.66 
 
 
255 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  50.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.47 
 
 
971 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 
290 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.06 
 
 
267 aa  50.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  30.1 
 
 
311 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  33.75 
 
 
258 aa  50.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.06 
 
 
838 aa  50.4  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 
325 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
509 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.82 
 
 
325 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
509 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
509 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
223 aa  50.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
509 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  34.57 
 
 
591 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1276  hypothetical protein  35.71 
 
 
183 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  29.59 
 
 
731 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  37.04 
 
 
329 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2371  Sel1 domain-containing protein  33.04 
 
 
372 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  30.1 
 
 
331 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  30.1 
 
 
331 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>