More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1536 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  100 
 
 		 476 aa  935    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  27.6 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  27.91 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  27.6 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  27.6 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  27.6 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  27.6 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  27.69 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  27.74 
 
 		 467 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  27.78 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  27.78 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  25.94 
 
 		 474 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  25.94 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  25.06 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  25.06 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  25.11 
 
 		 473 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  28.5 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  25.44 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  25.36 
 
 		 475 aa  103  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  23.35 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 504 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 504 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 504 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  25.07 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.28 
 
 		 440 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  22.66 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  26.63 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  25.32 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  22.73 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  26.17 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  26.13 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.74 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  23 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  23.8 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  23.8 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  23.8 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  23.8 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  23.8 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  23.8 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  23.8 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  23.8 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.15 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  23.94 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  22.97 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  23.74 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  26.65 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  26.65 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  26.37 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  26.37 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  26.37 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  26.37 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  26.86 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  26.37 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 521 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 521 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  25 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  26.1 
 
 		 475 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  25.45 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  21.45 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  23.12 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  23.15 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  24.68 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>