242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0593 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 
234 aa  454  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  47.68 
 
 
248 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  47.85 
 
 
204 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  45.54 
 
 
553 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  47.17 
 
 
539 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  45.41 
 
 
229 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  44.13 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  46.01 
 
 
201 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  43.81 
 
 
218 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  43.81 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  46.73 
 
 
209 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  43.81 
 
 
218 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  43.81 
 
 
218 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  43.81 
 
 
256 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  43.81 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  43.81 
 
 
218 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  45 
 
 
218 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  43.98 
 
 
259 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  47.89 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  42.25 
 
 
549 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  40.65 
 
 
541 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  45 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  43.13 
 
 
536 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  45.54 
 
 
204 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  42.01 
 
 
235 aa  138  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  47.49 
 
 
539 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  41.74 
 
 
225 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  43.3 
 
 
233 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  43.5 
 
 
218 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  44.55 
 
 
218 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  44.55 
 
 
218 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  44.7 
 
 
217 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  42.38 
 
 
531 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  42.98 
 
 
225 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  44.09 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  40.69 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  42.2 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  41.82 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  40.27 
 
 
218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  41.1 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  41.51 
 
 
562 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  41.74 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  50 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  43.18 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  39.62 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  44.39 
 
 
518 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  45.51 
 
 
230 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  43.06 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  42.73 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  43.36 
 
 
217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  43.54 
 
 
534 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  40.28 
 
 
522 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  38.46 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  41.04 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  41.98 
 
 
203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  40.09 
 
 
555 aa  128  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  38.46 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  40.74 
 
 
215 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  51.94 
 
 
218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  41.01 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  38.57 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  44.59 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  43.18 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  43.05 
 
 
539 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0097  allophanate hydrolase subunit 1  43.81 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  32.61 
 
 
229 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  46.46 
 
 
571 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  45.05 
 
 
219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  38.21 
 
 
242 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  33.16 
 
 
244 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  33.16 
 
 
244 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  42.53 
 
 
216 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  43.46 
 
 
243 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  44.02 
 
 
203 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  39.34 
 
 
237 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0094  allophanate hydrolase subunit 1  48.57 
 
 
247 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  39.46 
 
 
228 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  34.2 
 
 
243 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  38.84 
 
 
218 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  38.84 
 
 
218 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  38.17 
 
 
237 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  39.73 
 
 
219 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  44.13 
 
 
564 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  40.27 
 
 
216 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.76 
 
 
237 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  40.53 
 
 
240 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  38.38 
 
 
237 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  37.84 
 
 
237 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  39.09 
 
 
220 aa  121  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  35.65 
 
 
237 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  35.65 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  35.24 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  35.65 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  38.01 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  38.01 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  38.01 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>