More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4145 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 429 aa  876    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  67.7 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  59.72 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.28 
 
 		 415 aa  279  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  37.3 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  42.42 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  37.94 
 
 		 443 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  42.65 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  36.18 
 
 		 488 aa  245  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.8 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.18 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  38.18 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  38.67 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  37.43 
 
 		 457 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.92 
 
 		 421 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  33.78 
 
 		 449 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  35.01 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  37.8 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  36.39 
 
 		 456 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  37.28 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.45 
 
 		 870 aa  237  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  52.75 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  37.12 
 
 		 437 aa  236  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  46.83 
 
 		 816 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  45.93 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 		 440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  43.78 
 
 		 711 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  36.39 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  46.99 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  36.68 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  38.8 
 
 		 409 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  36.84 
 
 		 423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  32.11 
 
 		 410 aa  226  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  44.59 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  33.57 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.61 
 
 		 432 aa  223  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  35.6 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  40.58 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  44.96 
 
 		 478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  35.88 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.49 
 
 		 454 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  42.13 
 
 		 472 aa  219  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  41.86 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  33.96 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  48.93 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  34.43 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  40.88 
 
 		 402 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  37.59 
 
 		 472 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  41.03 
 
 		 421 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  45.96 
 
 		 254 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  33.18 
 
 		 472 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  40.89 
 
 		 455 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  47.74 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  45.73 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.41 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  43.59 
 
 		 244 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  46.44 
 
 		 498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  40.15 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  39.29 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  41.86 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  42.35 
 
 		 429 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  43.14 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  42.39 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 469 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 469 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  40 
 
 		 246 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0296  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.95 
 
 		 264 aa  207  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.26 
 
 		 549 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  48.48 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  44.81 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  41.43 
 
 		 418 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  36.42 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  40 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  204  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  39.73 
 
 		 649 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  40.42 
 
 		 247 aa  202  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 411 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  40.07 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  38.89 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  36.76 
 
 		 392 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  42 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0675  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.36 
 
 		 264 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00100596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0660  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  38.36 
 
 		 264 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00591854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  41.63 
 
 		 431 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  41.15 
 
 		 422 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  39.85 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  41.99 
 
 		 422 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>